北京荷斯坦牛乳成分微卫星标记的分析.pdf

北京衙斯灿牛乳成分豹微I!星标i止分析 微卫星DNAJ一泛存在于真核生物的基因组中，主要位于基因的非编码区，如艰lxl 的矧隔区和内含子内，也有的分布在基因的外显子和调控区(如启动子、增强于)中 简单重复序列分布的位置也有所不同(Nanda等，1991)。 ■ 1．2．2 序列示踪微卫星座位及微卫星DNA长度多态性(Simplesequence polymorphism，SSLP) 虽然微卫星DNA在基因组中分布广泛、均匀，且具有多态性，然而却无座位特异 tagged 垡的核心序列为中心，两侧各加上一段侧翼序列，这就构成了序列示踪微卫拱座位 microsatellite (Sequencetagged 并具有座位特异性，可通过PCR技术从基因组中特异检出。序列示踪微卫星座位的提 出，在微j卫星的研究中起到重要作用，大大丰富了微卫星标记的内涵，被称为较究荚的 标记。 可见微卫星DNA座位是由微卫星的核心序列及其两侧的侧翼序列构成。侧翼序列 使某一微卫星特异地定位在染色体某一位置上，而微卫星本身核心序列的重复次数则足 形成微卫星座位多态性的基础。其形成机制可能是由于在减数分裂过程巾的不平稳交换 复数与浚座位的等位基因数有强的『F相关，序列重复次数越多，其变异性越大，则该微 或其整数倍。 1．2．3微卫星DNA标记的遗传特点 jj’性：微卫星座位在哺乳动物种间，特别是一些紧密相关的物种如牛与羊，马属动物以 及鸡‘j火鸡问具有…定程度的保守性。(2)等显性遗传：微卫星标记遵循孟德尔邃传 规律，等位基因呈等显性遗传特点。(3)微卫星座位多态程度高：微卫星座位的变异 information 程度可用多态信息含量(Polymorphic J匕京抽tgiIt!小乳_lJ!i分的戳l!星机，让分材r 1994)。 1．2．4微卫星标记的应用 I．2．4．1构建遗传连锁图谱 分子标记是构建遗传连锁图谱必不可少的工具。所谓遗传连锁图谱是利用多态件的 遗传标记为路标，以两个基因座的交换率为图距(1％交换值为lcM)，反映摧吲的组l蚓。 微卫星DNA的广泛应用加快了家畜基因图谱的建立。用微卫星构建遗传连锁图谱的基 本想法是：以微卫星为基础，在基因组中每隔一定的距离找一个多态的微卫星标记，当 个是微卫星标记。 1．2．4．2微卫星标记与数量性状座位的连锁分析及定位主效基因和QTL 为了简化数量性状的遗传分析提高遗传改良的效率，简单而有效的途径之‘足建妒 遗传标记与数量性状问的相互关联关系。这种相互关联分机可以利用单个或少数标U进 行，也可以利用大量遗传标记所构建的遗传连锁图谱。 。旦发现了标记1J数量tl：状之11lJ 的显著相关，就可以将这种关联应用于MAS中，其应用效果取决于标记与性状之I叫关 联的密切程度。研究微卫星标记与数量性状的关联，在奶牛中相刈较多。 家畜中绝大多数有经济意义的性状都是受多基因控制且表现连续的数量性状，微效 多基因在基闵组中的分布不是随机的，通常是具有相关或相同功能的基酬集中分布j：彼 此相近的染色体区域，形成紧密连锁的基因簇，即所谓的数量性状位点。其中作用较大 它们定位在染色体j二。目前在牛的分子生物学研究中，如牛的双肌基因、Weaver基因、 早期流J。攮凶等具有重要经济价值的基因已被定位或发现了与其连锁的DNA标址，已 在育种中发挥着极其重要的作用，展现出基因定位和遗传图谱研究的价值。 1．2．4．3鉴定个体及亲缘关系 在动物生产过程中，每头动物都代表着生产者的利益，这使得快速可靠的识别个体 的谱系显得尤其重要。另外，弁种群中ni确的系潜记录对于有效的育种计划也足非常钳 北京付斯m小乳成分的微11星标记分析 个微卫星座位在一定群体中各等位基因的频率为基础来进行血缘关系的鉴定，准确率达 到99％以上。 1．2．4．4研究群体遗传结构及遗传变异 各种生物体表现广泛的遗传变异，而这种变化的根本是由遗传物质DNA的差异造 成的。因此直接利用DNA的变异研究动物群体的遗传多样性更有意义。根据微卫星多 态性的研究，可以对群体进行遗传分析。分子遗传标记J卜是这些表现变异制：、遵循饷-n 遗传方式的物质，