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第9卷第2期 生物信息学 V01.9No.2
201 China ofBioinformatics
1年6月 Journal Jun.,2011
1.02.008
doi:10.3969/j.issn.1672—5565.201
树干毕赤酵母(PichiaStipitis)木糖还原酶
(xyll)基因克隆与序列分析
孙博,葛菁萍+
(微生物黑龙江省高校重点实验室黑龙江大学生命科学学院,哈尔滨150080)
摘要:根据木糖还原酶基因序列相似的特点,设计一对引物获得PichiastipitisCICCl960的一段基因片段,此片段长度为
957bp,共编码318个氨基酸。利用生物信息学软件对该序列进行了同源性分析、氨基酸组成分析、疏水性分析、磷酸化位点预
测、CDS分析及二、三级结构预测。结果表明该片段为PichiaCICCl960木糖还原酶基因序列。
stipitis
关键词:PichiastipitisCICCl960;木糖还原酶;序列分析;结构预测
中图分类号:Q518.2文献标识码:A 文章编号:1672—5565(2011)一02—131—04
and ofthe
Cloning Analysis
Sequence Xylose
Reductase Pichia
Gene(xyl1)fromStipitis
SUN
Bo,GEJing—ping+
Laboratory 150080,China)
(Key ofMicrobiology,Collegeof蜘Science,HeilongfiangUniversity,Harbin
tothecharacterthatthe of reductaseare of werede—
similar,a
Abstract:According sequencesxylose pairprimers
inordertoobtaina inPichia CICCl960.Thewasabout that
signed genefragment stipitis fragment 957bpencoding
318amino thesoftwaresof was inthefieldsof
bioinformatics,this
acids.Using sequenceanalyzed
ofaminoacidand of domainsa—
addition,calculations sites,conserved
position hydrohobicity.In phosph01yration
and and structur
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