DNA自组装模型的几种分子逻辑门的计算.pdfVIP

第 37卷 第2期 合肥 工业 大 学学报 (自然科学版) Vo1．37No．2 2014年 2月 JOURNALOFHEFEIUNIVERSITY OFTECHNOLOGY Feb．2014 Doi：10．3969／j．issn．1003—5060．2014．02．012 DNA 自组装模型的几种分子逻辑 门的计算 单静怡， 唐静静， 殷志祥 (安徽理工大学 理学院，安徽 淮南 232001) 摘 要：分子逻辑门是 DNA计算机的重要单元，也是实现运算法则的基本条件。文章以DNA 自组装模型为 基础，构造了特殊的环状 DNA序列。通过将分子信标作为输入信号，或者对输人信号进行相应的标记，实现 了与非门、或非门和异或门3种常见复合逻辑门的构造。在结果读取中，用检测荧光强度的方法来判断逻辑 真值。反应后溶液中有荧光出现时，表示逻辑值为 1；反应溶液中没有荧光出现时，表示逻辑值为 0。在整个 实验过程中，只需要对DNA序列进行相应的设计 ，可减少因为反应复杂、反应步骤繁多引起的误差。该模型 操作简单，灵敏度高，为分子逻辑计算的实现提供了新的思路。 关键词：DNA自组装模型；环状DNA结构；逻辑门；分子信标；DNA计算 中图分类号：TP301．6 文献标识码：A 文章编号：1003—5060(2014l02—0176—04 Calculationofseveralkindsofmolecularlogicgate basedonDNA self-assemblymodel SHANJing-yi， TANGJing-jing， YINZhi—xiang (College0{Science．AnhuiUniversityofScienceandTechnology，Huainan232001，China) Abstract：ThemolecularlogicgateisnotonlyanimportantunitofDNA computer，butalsothebasic conditionofrealizingthealgorithm．Inthispaper，specialcircularDNA sequencesareconstructedon thebasisofDNA self-assemblymode1．Bymakingthemolecularbeaconastheinputsignal，ordoing thecorrespondingmarkontheinputsignal，thestructureoftheNAND gate，NOR gateandXOR gate，whicharethreekindsofcommoncomplexlogicgate，isrealized．Thelogicaltruthisdetermined bythedetectionoffluorescenceintensityinthereadingofresult．W henthefluorescenceoccursinthe solutionafterthereaction，itrepresentsa1ogica1valueof1，butwhenthereiSnofluorescence，itre— presentstheresultof0．Duringthetestingprocess，thecorrespondingdesignofDNA sequencesis onlyneeded，andthereisnocomplicatedreaction，whichcanreducetheerrorcausedbythecomplicat— edreactionandcumbersomesteps．Thismodelhastheadvantagesofsimpleoperationandhighsensi— tivity，anditprovidesanew ideafortheimplementationofmolecularlogiccalculation． Keywords：DNA sel~a