绒毛白蜡smh1基因编码区的克隆及序列分析-中国农学通报.pdfVIP

中国农学通报 2017,33(15):49-55 Chinese Agricultural Science Bulletin 绒毛白蜡smh1基因编码区的克隆及序列分析 1 2 1 2 2 2 张冬杰 ，燕丽萍 ，吴其超 ，刘翠兰 ，王因花 ，吴德军 1 （山东农业大学林学院，山东泰安271000 ； 2 山东省林业科学研究院/ 山东省林木遗传改良重点实验室，济南250000 ） 摘 要：为探究绒毛白蜡smh 1 端粒结合蛋白基因在端粒中的作用以及在植物生长发育过程中的调控机 制，进行绒毛白蜡smh 1端粒结合蛋白基因克隆及分析。以绒毛白蜡幼苗为试材，Illumina HiSeq 2000 高 通量测序技术获得的绒毛白蜡转录组Unigene 数据为基础，采用RT-PCR 方法克隆绒毛白蜡smh 1基因 编码区序列并进行生物信息学分析。结果表明：从绒毛白蜡叶片中成功克隆出一个smh 类端粒结合蛋 白基因编码区序列。基因编码区长度为879 bp ，可编码292 个氨基酸，分子量为31.66 kDa ，等电点为 6.5 ，原子总数为4457 个，分子式为C1371H2242N392O439 S13 。Conserved Domains 数据库对蛋白质的保守结构 域进行分析，结果显示该蛋白序列具有植物端粒结合蛋白Smh (single myb histone)亚家族典型的结构特 征，包括位于N- 端的Myb 样结构域以及中间的组蛋白H 1/5 样结构域。将FvSmh 1 端粒结合蛋白与含有 telobox 基序的其他端粒结合蛋白进行系统进化树的构建，结果显示SMH 端粒结合蛋白与TRF 1 和 TRF2 同属一个分支，具有较近的关系。从上述分析结果可以推断所克隆的绒毛白蜡smh 1基因可能对 植物端粒结构的维持和功能的发挥具有重要作用。 关键词：绒毛白蜡；端粒；端粒结合蛋白；克隆；序列分析 中图分类号：S722.5 文献标志码：A 论文编号：cas CloningandSequenceAnalysisofFraxinusvelutinasmh1GeneCodingRegion 1 2 1 2 2 2 ZhangDongjie,YanLiping,WuQichao,LiuCuilan,WangYinhua,WuDejun 1 (CollegeofForestry,ShandongAgriculturalUniversity,TaianShandong271000; 2ShandongAcademyofForestry/ShandongKeyLaboratoryofForestTreeGeneticImprovement,Jinan250000) Abstract:Tostudythefunctionof Fraxinusvelutinasmh1telomerebindingproteingeneintelomereandits regulationmechanismintheprocessofplantgrowthanddevelopment,weclonedandanalyzed Fraxinus velutinasmh1telomerebindingproteingene.Byselecting Fraxinusvelutina seedlingasexperimentmaterial and based on the transcriptome