结合叶绿体和核dna序列变异可提高云杉属物种的-plantdiversity.pdfVIP

植 物 分 类 与 资 源 学 报摇 2013,35 (3):375~385 Plant Diversity and Resources摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 DOI:10.7677/ ynzwyj201313083 结合叶绿体和核DNA序列变异可提高云杉属物种的分子鉴别率* 邹嘉宾, 王摇 茜, 李丽丽, 刘建全** (兰州大学生命科学学院草地农业系统国家重点实验室, 甘肃 兰州摇 730000) 摘要: 松科 (Pinaceae) 云杉属 (Picea) 植物是北半球广泛分布的重要森林树种, 由于频繁的种间杂交渐 渗及近期的辐射分化导致种间形态趋同, 传统的形态学方法很难准确鉴定该属物种。 近期兴起和发展的 DNA条形码技术为云杉属物种的划分和鉴定提供了可参考的方法。 在云杉属青藏高原种质资源收集过程 完成后, 选取5个叶绿体DNA片段 (matK, rbcL, trnH鄄psbA, trnL鄄trnF和trnS鄄trnG) 以及3个核DNA片 段 (4CL, Sb29 和GI), 利用PWG鄄distance和Tree鄄Building两种方法对青藏高原以及中国其他地区分布的 19 个云杉属物种 83 个个体进行了物种鉴别分辨率的评价。 研究结果显示单个的叶绿体 DNA 片段 (10.5% ~26.3%) 和核DNA片段 (15.8% ~26.3%) 对云杉属物种鉴别的分辨率较低, 组合的叶绿体 DNA片段的分辨能力 (15.8% ~42.1%) 虽然高于单个 DNA片段, 但分辨率最高的trnH鄄psbA+trnS鄄trnG 和trnS鄄trnG+trnL鄄trnF两个组合也只能达到42.1%; 组合的核DNA片段 (26.3% ~36.8%) 一样对云杉属 物种鉴别存在困难。 但是叶绿体DNA片段和核 DNA 片段的组合可以明显提高对云杉属物种鉴定的分辨 率, 尤其是trnS鄄trnG+trnL鄄trnF+4Cl 的组合片段, 其分辨率可达到57.9%。 因此在将来利用DNA条形码鉴 别物种时, 在常规DNA条形码片段不起作用的情况下, 可采用这种叶绿体DNA片段和核DNA片段组合 的方法来鉴定和区分植物物种。 关键词: 云杉属; DNA条形码; 核DNA片段; 物种鉴别 中图分类号: Q949;Q75摇 摇 摇 摇 摇 文献标识码:A摇 摇 摇 摇 摇 摇 文章编号:2095-0845(2013)03-375-11 The Combination of Chloroplast and Nuclear DNA Fragments Could Improve the Discrimination Power for Barcoding Spruce (Picea) Species ZOUJia鄄Bin,WANG Xi,LI Li鄄Li,LIUJian鄄Quan** (StateKey Laboratory of GrasslandAgro鄄Ecosystem,College of Life Sciences,Lanzhou University,Lanzhou730000,China) Abstract:Spruces (Picea),a genus of Pinaceae,are important components of the forests in the Northern Hemi鄄 sphere. Itisrelatively difficulttodistinguishspeciesbyusingtraditionalmorphologicalmethodduetofrequentinter鄄 specific hybridization and introgression,and radiative diversification. However,the emerging and developing of the DNA barcodingmethodsprovideanalternativeapproach. Inthisstudy,wetestedthediscriminationpowersbe