16SrDNA测序在细菌性重症肺炎痰液致病菌分析中的应用.pdf

宁夏医学杂志2013年 11月第 35卷第 11期 NingxiaMedJ，Nov．2013，Vol35，No．11 文章编号：1001—5949(2013)11—1019—03 ·论 著 · 16SrDNA测序在细菌性重症肺炎 痰液致病菌分析中的应用 杨晓军 ，王晓红 ，王妍柏 ，王振海 [摘要] 目的 采用 16SrDNA测序，分析重症肺炎痰液中致病菌构成 ，探索病原学诊断的新方法。方法 收 集细菌性重症肺炎患者的痰液标本 ，运用聚合酶链反应 (PCR)扩增及高通量测序技术 ，对标本中病原菌 16SrDNA V3～V5区进行多样性分析。结果 测序显示痰液样本含有的物种种类相对较多，还存在较多未被测序检测到的 物种，优势菌属主要为链球菌属、变性菌属、不动杆菌属、鞘氨醇单胞菌属 、普氏菌属、克雷伯菌属、假单胞菌属、水 杆菌属、棒状杆菌属等。结论 细菌性重症肺炎痰液致病菌种复杂多样 ，物种丰富，16S—rDNA测序是临床实践中 一 种新的尝试。 [关键词] 细菌性重症肺炎；痰液；致病菌；16SrDNA测序 [中图分类号] R563．2 [文献标识码] A 16SrDNA sequencingofthepathogensinsputum samplesfrom patientswithseverebacterialpneumonia YANGXiaojun，WANGXiaohong，WANGYanbai，WANGZhenhai．1．IntensiveCareUnit，GeneralHospitalofNingxiaMedicalUni— versity，Yinehuan750004，China；2．NeurologyDepartment，GeneralHospitalofNingxiaMedicalUniversity，Yinchnan750004，China [Abstract] 0bjective Toexplorenewwayofetiologicaldiagnosisby16SrDNAanalysis．Methods Inthisstudy，sputumsam— plesfrom patientswithseverebacterialpneumoniawereenrolled，PCRandareliablehigh—throughputsequencingmethodwasusedtoa- nalysisthediversityinwhichthe16SrDNA V3一V5hypervariableregionsofthebacteriacontainedinthesputum．Results Thesequen- cingrevealedthatsputum samplescontainedarelativelylargenumberofspeciesandtherewerealsomanyspecieswhichwerenotdetec— tedbysequencing．TheadvantagepathogenmainlycontainedStreptococcus，Proteus，Acinetobacter，Sphingomonas，Prevotella，Klebsiella， Pseudomonas，Aquabacterium ，Corynebacterium andSOon．Conclusion Thespeciesinsputum ，whichenrolledrfom patientswithsevere bacterial pneumonia，arecomplexanddiverse．16S—rDNA sequencingwouldbeanew attemptusinginclinicalpractice． [Keywords] Severebacterialpneumonia；sputum；Pathogens；16SrDNA 重症肺炎病原菌诊断困难、预后差，其转归与细 诊断的新方法。 菌致病力以及抗生素治疗的及时性和针对性密切相 1 资料与方法 关，因此早期诊断对患者的预后意义极大…。痰液