细胞分子生物学（扬州大学）第二章 蛋白质结构.pptVIP

第一节 氨基酸 二 氨基酸特性与分类 氨基酸的特性主要由其侧链决定 不同氨基酸侧链的大小、形态、电荷、疏水性和反应性等均有所不同 1 极性中性氨基酸 2 非极性脂族侧链氨基酸 3 酸碱性氨基酸 4 特殊氨基酸 由于侧链的独特特点，半胱氨酸（cysteine, Cys/C）、甘氨酸（glycine, Gly/G）和脯氨酸（proline, Pro/P）在蛋白质中具有特殊作用 半胱氨酸的侧链含有反应性巯基（-SH），可氧化成与另一半胱氨酸连接的共价二硫键，使蛋白链内不同区域或蛋白链之间发生铰链，对折叠蛋白结构具有稳定作用 甘氨酸是最小的氨基酸，其侧链为一个氢原子，体积小能使其填入紧密空间中 与其它普通氨基酸不同，脯氨酸侧链可以折转形成一个环，使蛋白链形成一个固定的扭结，从而限定蛋白质在脯氨酸区域的折叠方式 第二节 蛋白质结构 蛋白质形状主要有球形和丝状 球形蛋白质折叠紧密，在溶液中大致为球形颗粒，如大多数酶 丝状蛋白质有一个很高的长／宽比（轴比），通常是重要的结构蛋白，如毛发丝心蛋白和角蛋白 有些蛋白质的分子量仅为几千道尔顿（Da）,而有些蛋白的分子量可达5000kDa以上 某些蛋白质还含有非蛋白成分，包括脂类、碳水化合物或某些共因子等 二 蛋白质一级结构 在蛋白多肽链中，一个氨基酸的?-羧基与另一个氨基酸的?-氨基以肽键相连，这种结构称为蛋白质的一级结构或初级结构 ?-碳原子和肽键的重复为多肽链提供骨架，而不同的氨基酸侧链决定蛋白的功能 所有多肽链都是双向的，各有一个氨基端（简称N-端）和羧基端（简称C-端），在某些情况下，N-端可被乙酰基等封闭 由两个氨基酸连接而成者称为二肽，由多个氨基酸连接而成者称为多肽 虽然多肽链长短不一，但典型多肽链的长度一般为100-1500个氨基酸 三 蛋白质二级结构 肽键单元之间的氢键连接使多肽链折叠成有规律的二级结构，主要有α螺旋、β折叠、β转角等形式，它们是构成蛋白质高级结构的基本要素 α螺旋(α-helix)是蛋白质中最常见、最典型、含量最多的二级结构元件，每个螺旋周期包含3.6个氨基酸残基，残基侧链伸向外侧，同一肽链上的每个残基的酰胺氢原子和位于其后的第4个残基上的羰基氧原子之间形成氢键，因此一条多肽链呈α-螺旋构象的推动力就是所有肽键上的酰胺氢和羰基氧之间形成的链内氢键 β折叠(β-sheet)也是一种重复性结构，可分为平行式和反平行式两种类型，它们是通过肽链间或肽段间的氢键维系 可以把β折叠想象成由折叠的条状纸片侧向并排而成，每条纸片可看成是一条肽链，称为β折叠股或β股(β-strand)，肽主链沿纸条形成锯齿状，处于最伸展的构象，氢键主要在股间而不是股内 α碳原子位于折叠线上，由于其四面体性质，连续的酰氨平面排列成折叠形式 需要注意的是在折叠片上的侧链都垂直于折叠片的平面，并交替的从平面上下二侧伸出 平行折叠片比反平行折叠片更规则且一般是大结构，而反平行折叠片可以少到仅由两个β股组成 β转角(β-turn)是一种简单的非重复性结构 在β-转角中，第一个残基的C=O与第四个残基的N-H氢键键合形成一个紧密的环，使β转角成为比较稳定的结构，多处在蛋白质分子的表面 β转角的特定构象在一定程度上取决于其组成氨基酸，某些氨基酸（如脯氨酸和甘氨酸）经常存在其中 由于甘氨酸缺少侧链(只有一个H)，在β转角中能很好地调整其他残基的空间阻碍,因此是立体化学上最合适的氨基酸 脯氨酸具有换装结构和固定的角，因此能在一定程度上迫使β转角形成，促使多肽自身回折，且这些回折有助于反平行β折叠片形成 四 蛋白质三级结构 在三维空间内，蛋白质二级结构进一步折叠成三级结构，其本质由初级结构决定 在适宜体外条件下，多数多肽链能以最低的能量自发折叠成正确的三级结构，但体内新生肽链的折叠往往需要侣伴蛋白的参与 亲水性氨基酸区域通常位于折叠肽链的表面，而疏水性氨基酸区域则被包埋在折叠肽链的内部 三级结构可通过侧链间的非共价键保持稳定，包括范德瓦耳斯力、氢键、反向电荷基团之间的静电盐桥和脂族与芳香族氨基酸侧链间的疏水作用力 五 蛋白质四级结构 许多蛋白质由两个或多个多肽链组成，这种结构称为四级结构（quaternary structure），其中的多肽链称为亚单位，可以是相同（同源）或不同（异源）的亚单位 四级结构的稳定力与三级结构相同，包括不同肽链上半胱氨酸之间的二硫键 四级结构通过将不同肽链及其活性进行整合，形成结构和功能更为复杂的蛋白分子 六 蛋白质功能分类 1、酶蛋白：除少数有催化活性的RNA分子外，几乎所有的酶都是蛋白质 2、信号传递蛋白：细胞表面的受体蛋白与细胞外的配体蛋白结合，导致后者的构型改变，从而向细胞内传递信号，启动相应的应答反应 3、转运与贮存蛋白：血红蛋白在红细胞中转运氧气，转铁蛋