结合中心氨基酸组成成分预测固有不规则蛋白质.pdfVIP

Comptlter En舀neeringn越Applic口tions诗_真视．j毽与霞甩 结合中心氨基酸组成成分预测固有不规则蛋白质 贺波，王科俊，冯伟兴，许诺琳 HE W萌xin Nuolin Bo，WANGKejun，FENGg，XU 哈尔滨工程大学自动化学院，哈尔滨15000l ofAutomti鸭Harbin 15000l，China College EngineeringuniVers咄H抽in HE disordered ceⅡtI。aIaminoacjd Bo，V吼^．NG Ke扣n，FENGwbixing，eta1．Predictingintrinsica¨y pmteinsbyusing compos“ and Engineering tions．Computer AppUca廿ons，2012，48(2)：133-134． Abstract：Duetothedi币cultieswithfeatIlreextractioninmeshortdisordered metllodbasedontllec∞臼alaminoacidcom— re西ons，a is t0 of枷inoacidSin廿1ewindowsis t0builda positionspro】posedpredictintrinsicallydisord删rcgions．The丘弼u锄cy computed windows．Thestatistics thattllecenn训锄inoacidsfomldisorderedstnJctureis sub-predictorbyusingsliding probability computed舔 newfeature．Theresultsof newfeaturesarecombiIled coe衔cients锄dbuiIda for sub·predictor锄d byweighting predictorintrinsically onthe me disorderedbased combinedmodel．TheresuItsshowthatthis not obtaim tIlan pmteins predictoronly slightlyhigheraccumcy most disordered also tlle ofshortdisordered prcdictorsforlong regions，butiIllprovessi鲥ficantlypredictiIlgaccuracy regions． 1‘ey words：protcin；试trinsicallydisordcr；p删iction 摘要：在固有不规则蛋白质结构预测过程中，针对短的不规则结构区域特征提取困难，提出一种结合中心氨基酸组成成分进行 预测的方法。利用滑窗技术，计算20种氨基酸在窗口内出现的频率，构建一个子预测器；计算窗口中心氨基酸形成不规则结构的 统计概率，以此作为新的特征参数；对子预测器的结果与新的特征参数分别赋予一个系数，进行加权组合，建立基于组合模型的 固有不规则蛋白质结构预测器。实验结果表明，该预测器在保持对长的不规则结构区域预测精度较高的前提下，能够显著提高 短的不规则结构区域的预测精度． 关键词：蛋白质；固有不规则结构；预测 DOI：10．3778a．ism．1002．8331．2012．02．038文章编号：1002．8331(2012)02．