代谢模式识别技术在胃癌诊断中的应用(1).pdf

增刊 化 学 世 界 ·31· 代谢模式识别技术在胃癌诊断中的应用 屠媛“．李通化1。 陈开1。 张晓东2 (1．同济大学化学系。上海，200092；2．上海交通大学医学院，上海200025) 关键词：基于NMR的代谢组学；疾病诊断；模式识别；最大归一(Inf-nom)；KPLs 目前，胃癌在全世界范围内发病率仅次于肺癌， 异峰，该峰很有可能就是胃癌的靶标代谢物。 位居第2位[1]。它是一种胃上皮组织的恶性肿瘤， 5 其往往会严重影响消化从而带来代谢障碍。因此， O 苦 5 代谢组学技术非常适合胃癌的研究，而模式识别是 一 爸 O 代谢组学应用于疾病诊断的核心分析技术，近年来 蠹 5 勺 口 0 发展迅速[2]。尤其基于N凇的代谢组学技术，其 ： o 5 《 在疾病诊断中的作用越来越突现，并且出现一些成 O 功应用睁5I。 5 2．7U 2．75 2．80 2．85 2．90 2．95 3．0U 本文主要研究基于NMR的代谢组学数据处 ChemicalshifV×lO-6 理，研究了三种预处理方法，得到了识别效果达到 a．胃癌组截图：b．下方为普通组 98％的最大归一方法；通过比较三种预测模型体系， 图1胃癌靶标峰 得出适合于代谢组学数据处理的优良模型，可完全 2不同归一化方法的PCA分析 准确地识别癌症。 模式识别中，主成份分析(PCA)是最常用也最 l实验数据采集 为重要的无监督方法。数据导人PCA前，往往要对 实验所用的血清样品均来自上海交通大学医学 其进行一定的预处理，归一化法是典型的方法。本 院附属新华院：实验样品包括25位确诊为胃癌患 文讨论了代谢组学中常用的3种数据归一化方法， 者、25位无明显疾病患者(对照组)以及10位待测 公式见表1。 病人的血液。其中胃癌组男性12名，女性13名，平 表l常用的三种归一化方法 均年龄为61，待测病人从医院病房随机抽取。 方法 公式1’ 1．1血清收集 lnf_Norm 以，2南 抽血前空腹禁食8h，早上同一时间段抽取每 位病人5mL静脉血，在3600r／min条件下离心2 1-Nom z7¨一