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中医药院校研究生生物信息学教学初探
中医药院校研究生生物信息学教学初探
李姗 王丽 孙洁 张炅 陈芳 朱珠 高爱社
河南中医药大学
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摘????要:
生物信息学是现代生命科学的重要组成部分, 是目前基因组学、蛋白质组学和生物芯片等生命科学前沿研究的直接推动力。生物信息学课程, 有助于培养研究生开拓思维和创新能力、为科研和临床工作提供先进的研究方法和强有力的辅助手段。文章针对目前中医药院校研究生生物信息学课程的现状和问题, 从教学团队、教学内容、教学模式、教学安排等方面进行探讨, 并提出相应对策, 为提高生物信息学教学质量提供参考。
关键词:
中医药院校; 生物信息学; 教学;
作者简介:李姗, 医学博士, 讲师。研究方向:病理学、病理生理学教学与科研。
作者简介:高爱社, 医学博士, 副教授, 硕士生导师, 河南中医药大学病理学与病理生理学学科主任。研究方向:病理学、病理生理学教学与科研
收稿日期:2017-03-29
基金:河南中医药大学2016年度“科研苗圃工程项目 (教学研究) ” (项目编号:MP2016-43)
Received: 2017-03-29
生物信息学也称计算生物学, 运用数学、信息学、统计学和计算科学等领域的技术来解决生物学问题。主要是通过开发各种算法和计算机软件, 对核酸和蛋白质的特征性序列和结构域进行扫描和分析, 对核酸和蛋白质序列排列、基因发现、基因组组装、蛋白质结构预测、基因表达预测、蛋白质-蛋白质间相互作用进化研究, 从而预测核酸和蛋白质的结构和功能及其应用潜力[1]。在医学研究和应用中, 利用生物分子数据及分析结果, 可以大大提高研究和开发的科学性及效率。因此, 开设生物信息学课程能够为科研机构、高等院校和医疗医药等相关部门和行业提供大量人才, 促进生命科学及相关学科的发展。生物信息学作为一门前沿交叉学科, 综合性强, 发展速度快。目前, 我国很多中医药院校尚没有开设此课程, 即使开设也是刚刚起步, 缺乏完善的教学模式和有效的教学方法。本文对中医药院校研究生生物信息学课程教学存在的问题进行分析, 并提出相应对策, 为提高生物信息学教学质量提供参考。
1 中医药院校开设生物信息学课程的重要性
近年来, 世界对中医药的需求日益增强, 中医药正加速度步入国际舞台。国务院《中医药发展战略规划纲要 (2016~2030年) 》指出, 要加强中医药对外交流合作, 实施中医药海外发展工程, 推动中医药技术、药物、标准和服务走出去, 促进国际社会广泛接受中医药。科研工作具有很强的推动力和生命力, 要使世界接受中医药传统文化, 体验中医药神奇疗效, 必须发展中医药科研, 保证中医药科研在国际医学研究领域中处于领先地位。
生物信息学为中医药科研提供了先进的研究方法和强有力的辅助手段, 是目前基因组学、蛋白质组学和生物芯片等生命科学前沿研究的直接推动力。例如, 传统的中药物研究从筛选有效的药效成分到该药物的临床应用, 需要花费大量的时间, 以及人力、财力[2], 但根据人类基因组研究结果, 利用生物信息学预测药物靶标, 再进行相关研究, 可以做到有的放矢, 节省大量时间和研究费用。但是到目前为止, 中医药院校很少有教师精通生物信息学, 更不会将生物信息学相关知识用于中医药研究当中, 这就造成课题研究的盲目性, 培养出来的研究生也是单一人才, 缺乏创新能力, 不能适应中医药迅速发展的需要。中医药科研工作者要在思想上抛弃单纯模仿和重复的思想, 利用生物信息学技术在科研中积极探索、创新[3]。为促进我国科学教育事业的发展, 为国家培养大批具有国际竞争力的中医药传承人才和开拓意识的创造型人才, 中医药院校开设医学生物信息学势在必行。
2 中医药院校生物信息学教学现状
2.1 缺乏相应的教学团队
生物信息学是一门综合性很强的交叉学科, 要开设这门课程, 要求教师不仅应具备多学科背景, 精通生物信息学相关学科如计算机科学、医学统计学、分子生物学、分子遗传学及病原生物学的知识, 还要时刻关注学科的发展动向[4]。因此, 长期应用生物信息学、具有医学背景的教师或科研工作者更适合作为该门课程的授课教师。但遗憾的是, 中医药院校中的很多教师不是专门从事生物信息学研究的科研人员, 他们大多数精通中医理论知识, 缺乏生物信息学相关学科的知识, 有的甚至从未使用过生物信息学软件。少数教西医课程的教师也只熟悉某一学科方面的知识, 对其他学科了解不深, 这势必增加了教学难度。因此, 中医药院校的生物信息学课程尤其缺乏优秀的师资力量。
2.2 缺乏相应的教材资源
这是中医药院校研究生生物信息学教学存在的普遍问题。因生物信
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