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两点杂交 多点杂交 RFLP连锁图 ? RFLP 作图的程序 与经典遗传作图类似,只是统计性状改为DNA 分子标记; 程序：选择已知基因型的亲本 → 设计杂交方案 → 获得交配的子代 → 分析其DNA分子标记 * * * * 本章主要内容： 第一节 遗传作图基本概念 第二节 遗传作图的分子标记 第三节 遗传作图的方法 第一节 遗传作图基本概念 1. 遗传作图定义 采用遗传学分析方法将基因或其他DNA顺序标定在染色体上构建连锁图。 2. 遗传作图的基本原理 随机的染色体上两个任意基因座越远，它们越容易被染色体断裂所分离。 3.遗传图距的单位 厘摩（cM）:每单位厘摩为1％交换率。 交换率或交换值或重组频率= 减数分裂的重组产物\减数分裂的总产物 4.遗传作图的主要方法 杂交实验、 家系分析 第二节 遗传作图标记 基因标记 孟德尔 — 肉眼→ 豌豆植株高矮、豌豆颜色等 摩尔根 — 显微镜、肉眼→ 果蝇躯体颜色、翅膀形状等 生化表型→细菌、酵母遗传学研究；人类中如血型系列（ABO）分析、血清蛋白和免疫蛋白 基因标记的缺点 高等生物，如 脊椎动物和显花植物等，可用作标记的基因十分有限，许多性状都涉及多基因； 高等生物基因组中存在大量的基因间隔区，纯粹用基因作为标记将在遗传图谱中留下大片的无标记区段； 只有部分基因其等位基因成员可以通过常规试验予以区分，因而产生的遗传图是不完整的，必需寻找其他有效的标记； 183个RFLP, 多态性不够高，杂合性（PIC）平均达 到 0 .3而且在染色体上分布不均匀，难以将一些罕 见的基因进行定位；对多基因病的定位也难以奏效, STR位点已经达到8000个，平均 100kb－200kb有 一个 STR位点，杂合性（PIC）平均达到 0 .7, 这已经使得连锁分析的功能发挥到了极限。 SNP位点已经达到数十万个，平均 1000bp有 一个 ，估计1700万个(40个人筛选结果）。 (短串联重复序列,STRs ,short tendem repeats) 2.3 分子标记 RFLP(restriction fragment length polymorphisms,限制性片段长度多态性) RFLP的特征: ? 处于染色体上的位置相对固定; ? 同一亲本及其子代相同位点上的多态性片段特征不变; ?同一凝胶电泳可显示不同多态性片段,具有共显性特点; SSLPs(Simple sequence length polymorphisms,简单序列长度多态性) ? SSLP 产生重复序列的可变排列,同一位点重复次数不同,表现DNA序列长度变化; ? 与RFLP 不同,具有多等位性; ? 小卫星(minisatellite)和微卫星(microsatellite)序列都可用于遗传作图,但微卫星更普遍; SNP(single nucleotide polymorphisms,单核苷酸多态性) 1996年，Lander报道了SNP，制备第三代遗传连锁图的遗传标记。 ? 基因组中单个核苷酸的突变称为点突变; ? 理论上每个单核苷酸位置最多只有4种形式,但某些群体特定的单核苷酸位置只有2个或3个SNP,这些位点称为双等位或三等位; ? 在基因组编码顺序中，SNP 大多位于密码子的摇摆位置，表现为基因沉默而被大量保留下来; ? 大多数SNP所在的位置不能被限制酶识别，必须采取测序或寡核苷酸杂交检测; ? SNP 在基因组中的数量极大.二倍体细胞中每个SNP最多只有2种等位型; /SNP/index.html 第三节 遗传作图的方法 遗传学简介 等位基因随机分离定律 独立遗传定律 完全连锁 不完全连锁 不完全显性 共显性 如何进行遗传作图？ 孟德尔第一定律 等位基因随机分离(The Law of Segregation) ♀ ♂ × A A a a A a F1 Parents F2 A A a a A a 1:2:1 A:a=1:1 孟德尔第二定律 独立分配定律(the law of independent assortment) ♀ ♂ × F1 Parents F2 如何进行遗传作图？ AaBb AB Ab aB ab 25% 25% 25% 25% AB(25%) Ab(25%) aB(25%) Ab(25%) AABB AABb AaBB AaBb AABb AAbb AaBb Aabb AaBB AaBb aaBB aaB