[医学]静息态磁共振数据处理.pdf

静息态脑功能数据处理培训 张寒 杭州师范大学认知与脑疾病研究中心 napoleon1982@ 2011/11/10 主要内容 • Matlab基本操作 • REST /DPARSF/DPARSFA软件介绍 • SPM处理数据常遇到的问题 • ICA分析静息态fMRI数据 • 静息态近红外脑功能成像(fNIRS) 主要内容 • Matlab基本操作 • REST /DPARSF/DPARSFA软件介绍 • SPM处理数据常遇到的问题 • ICA分析静息态fMRI数据 • 静息态近红外脑功能成像 Matlab基本操作 The MathWorks Co. Matlab 6.5, Matlab 7.1, Matlab 7.3, Matlab 2009a, Matlab 2010a … Matlab界面的基本组成部分 Matlab基本概念: Working Directory working directory 即current folder，所有的生成的数据，默认都是放在这里。 Matlab会最先搜索这里的文件。打开文件选择窗口，最先到这里。 •怎么每次要找半天才能找到我的数据所在文件夹？ 相关命令：pwd •怎么我的程序一会能运行一会不能运行？ cd •SPM生成的结果报表ps文件到哪儿去了？ dir Matlab基本概念: Command window Command窗口：你和matlab对话的地方。 如果在命令结束后不加“；”，matlab就直接打印结果，但是会慢！所 以批处理时，一定要记得加“；” 。 Matlab的报错信息，都会出现在这里，要留意观察！ • Matlab怎么一直在出各种数字？ • 程序怎么没有运行出结果？ • 上面一行红字是什么意思？ • 程序运行出错了怎么办？ Matlab基本概念: Workspace, variable Workspace 内储存“变量” 。变量不会存在硬盘里，存在计算机内存中。 可以向windows里一样浏览变量，双击则打开变量。 内存中的数据，一旦关闭Matlab，不可恢复。 可以通过save命令，将workspace 的数据转入Working directory 中，以写 入硬盘的方式存起来。load命令则相反。 注意：Workspace 的数据，如删除需要用clear XXX删除，如只写clear， 将全删。 • 为什么叫变量（variable）？ • 为什么我计算得到的结果关了Matlab后就消失了？ 变量编辑窗口 可以自由对变量内容进行编辑。 类似SPSS，EXCEL界面。 自由的复制粘贴。 whos可以列出： a 变量名 6 ×1 变量的维度，大小 double 变量的类型（默认） • 变量太大内存不够了怎么办？ • 想看看时间序列