化学信息学概论.ppt

Chemical Informatics 第一章 化学信息学概论 化学信息学 主讲:沈效峰 化学信息学教材及参考书 教材 化学信息学导论 ，缪强，高等教育出版社 参考书化学信息学，陈明旦，化学工业出版社 化学文献及查阅方法，余向春，科学出版社 Internet上的化学化工资源，李晓霞，郭力，科学出版社 化学信息学，邵学广，科学出版社 化学信息学教学内容安排 第一章 化学信息学概论 第二章 化学化工网站与网上数据库 第三章 化学化工文献检索 第四章 专利文献检索 第五章 常用化学化工软件及使用方法 第六章 化学化工期刊 第七章 化学化工手册与工具书 化学信息学教学课程安排 理论课：第1~4，6~8，10~11， 13~14，16周 上机实验课：第5，9，12，15周下午 笃南A 第一章 化学信息学概论 什么是信息? 信息是事物存在方式和运动状态的记录 精确地描述物体或事件,消除不确定。 独立于物质和能量以外的自然的第三属性。 信息的载体 遗传密码：生物信息， 语言、文字、图象：表达思想情感和传递知识的人类信息， 二进制编码：现代信息技术的基础。 信息已经成为与材料、能源同等重要，甚至更为重要的资源。 第一节 化学信息及化学信息学 现 状 截止1999年12月31日，美国化学文摘登记的分子、化合物和物相数目已超过23,000,000种，但有百年历史Merck Index《默克索引:化合物,药物和生物制品百科全书》 (1996)，收录的分子和化合物只有10,330种，占0.05%，从最大的试剂商店和药房能买到的药品和试剂不超过10,000种。 所以目前在起作用（为人类服务和为非作歹）的分子和化合物不到0.05% ，而其中有突出贡献的更不到0.001% 。99.9%以上的分子深藏在文献库中。 化学信息学是近几年来发展起来的新的化学分支。 迄今为止，化学信息学还没有统一的被广泛接受的定义及英文名称。目前最通用的为Chemoinformatics及Chemical Informatics。也有用Cheminformatics,Chemi-informatics。 一、什么是化学信息学 化学信息学是信息科学与化学的交叉学科 利用数学、统计学与计算机科学的理论、方法和网络技术作为手段，研究化学信息的获取、表示、管理、传播、分析、加工和应用，在此基础上进行知识创新，促进化学学科的发展。 化学、化工及其相关领域的信息需求 科学研究 化学工业生产及技术 商务活动 教育 1、化学信息的构成 A. 化学化工文献信息（包括专利信息） B. 化学化工反应126 C. 化学结构信息/物理化学性质/图谱信息111 D. 化学化工及其相关领域的科学研究 化学信息的构成（续） E. 化学工业生产技术、商务信息与商务活动 F. 化学教育与教学中所传递和涉及的信息 G. 基于Internet的与化学有关的其它信息 （远程教学/远程会议/在线交流/网络资源等) H、超分子化学过程、分子自组装过程中所表达的分子信息122 2、获取化学信息的途径 1、化学化工文献检索 2、实验测量、查阅数据或图谱、数据处理 3、计算机模拟/计算机仿真， 根据已有化学知识和物理定理，通过计算机推演、大规模计算、预测或再现化学结构、化学性质和化学过程 3、化学信息学的特点 以计算机科学、网络与通讯技术为基础整合了众多领域。 涉及化学、化工、生物、材料、环境、能源、地球与空间资源、冶金、器件（传感器、分子器件与纳米机器）等 4、化学信息学研究的内容 化学信息的产生和获取 利用检索工具 通过实验方法 ... … 化学信息的表达、存储和管理 化学运筹学 数据整理可视化 数据库管理技术 ... ... 化学信息学研究的内容 化学信息的加工和处理 化学计量学 化学软件 目的是获取更多的信息 ... … 化学信息的深化 化学模式识别 计算机模拟设计 ... ... 1、化学化工文献学、情报学 期刊文献、专利文献、电子及在线期刊 在线会议与讨论 机构、人物、会议、教育与教学信息 工艺、产品、价格、商务与投资信息 求职、就业、招聘与服务信息 物性、化学数据及化学反应信息 化学结构的两维与三维表示、结构检索与匹配 信息存储、检索及输出方法 2、化学计量学、数据库与人工智能 实验设计、采样与检测、校正方法 信号处理与谱解析 化学模式识别与因子分析 人工神经网络、遗传算法 系统优化与智能控制 网络与数据库技术、数据挖掘技术 人工智能与专家系统 3、高性能计算与模拟（计算化学） 分子计算与模拟方法 分子设计、材料设计与药物设计 生物大分