基因克隆载体小结.pptVIP

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3.1质粒克隆载体 3.2 病毒克隆载体 3.2.1 λ噬菌体载体 3.2.2 cosmid克隆载体 3.2.3 M13噬菌体克隆载体 3.2.4 CaMV克隆载体 3.2.5 烟草花叶病毒(TMV)克隆载体 3.2.6 SV40克隆载体 3.3 染色体定位整合克隆载体 3.4 人造染色体载体:细菌人工染色体;酵母人工染色体 特殊用途克隆载体 质粒克隆载体的构建 选择合适的出发质粒 正确获得构建质粒克隆载体的元件 组装合适的选择标记基因 选用合适的启动子 构建过程简单 大肠杆菌质粒克隆载体pBR322 及其衍生物质粒克隆载体的构建 pBR322质粒的结构特征: 大小:4.3kb 具有ColE1拷贝复制子 选择标记:Amp,Tet 24种限制性核酸内切酶单一位点; BamHI等导致Tet插入失活; PstI等导致Amp插入失活。 pUC质粒载体的结构特点 pBR322的复制起点 Amp标记 大肠杆菌β-半乳糖苷酶基因LacZ的启动子及编码α-肽链的DNA序列——LacZ’ 在LacZ’的5‘端有1段多克隆位点(MCS)区段。 农杆菌Ti质粒克隆载体的构建 Ti质粒(Tumor inducing plasmid)——存在于植物的土壤农杆菌中,诱发植物产生冠樱瘤的质粒。 冠瘿瘤(crown gall)是一种植物肿瘤,一堆未分化的组织团 分为4种类型: 章鱼碱型(octopine) 胭脂碱型(nopaline) 农杆碱型(agropine) 农杆菌素碱型(琥珀碱型,succinamopine) 1.Ti质粒的结构和特性 Ti质粒是根癌农杆菌染色体以外的遗传物质 双链闭合环型DNA 200-250kb 结构分为4个功能区: T-DNA区 Vir区 Con区 Ori区 双元中间克隆载体—微型质粒(mini-Ti plasmid) 含有T-DNA左右边界 含有广谱质粒的复制起始位点(oriV)和转移起始位点(oriT) 在大肠杆菌中多拷贝复制 病毒(噬菌体)克隆载体 病毒克隆载体 噬菌体克隆载体 λ噬菌体克隆载体 与构建克隆载体相关的λ噬菌体性质 λ DNA: ——在噬菌体中是线状DNA分子,进入寄主细胞后呈环状DNA分子。 ——长48kb。 ——左右两端各有12bp组成的彼此完全互补的粘性末端。形成cos位点。 ——包括61个基因,其中1/2参与了噬菌体生命周期,是必要基因,另1/2属于不必要基因,用于基因工程操作。 选用λ噬菌体作为构建克隆载体材料的依据 cosmid克隆载体 ——cosmid = cos site-carrying plasmid 构建cosmid克隆载体的策略 具有噬菌体载体的高转导性能:保留cos位点以及包装的相关基因。 结合质粒载体的自我复制性能,改变质粒载体携带外源DNA小的缺点。 cosmid克隆载体的特征 环型DNA分子,大小不超过36kb。 具有质粒性质,可以转化大肠杆菌,并自我复制,有RE切点。 有cos位点,提供包装的条件。具有λ噬菌体的特性。在克隆了合适长度的外源DNA,并在体外被包装成噬菌体颗粒之后,可以高效转染对λ噬菌体敏感的大肠杆菌寄主细胞。进入寄主细胞之后的粘粒DNA分子,能按照λ噬菌体DNA同样的方式环化。 承载大的外源DNA片段。见教材113页。 M13噬菌体克隆载体 M13 DNA 环型单链DNA,(+) 长6.4kb, 分10区和1间隔区 间隔区内可以插入外原DNA。 定位整合克隆载体的几种模式 内源平台双交换置换克隆载体 外源平台双交换置换克隆载体 内源平台双交换插入克隆载体 内源平台单交换插入克隆载体 定位整合克隆载体 植物染色体定位整合克隆载体 动物染色体定位整合克隆载体 思考题 一.概念 严紧型质粒;松弛型质粒;质粒的不亲和性;克隆载体;表达载体;穿梭载体; α-互补;冠瘿碱; T-DNA ;双元中间克隆载体;中间质粒克隆载体;COS位点;整合平台;定位整合克隆载体 二.问答题 1.基因克隆载体的条件? 2. pUC质粒载体的优点? 3.农杆菌Ti质粒如何将外源DNA整合到植物染色体上? 4.如何建立重组λDNA分子体外包装系统? 5. 为什么M13载体是成对出现的? 大鼠定位整合克隆载体 整合平台——大鼠乳清酸蛋白WAP启动子的调控序列 + 3‘UTR序列 (1) BAC是环状 DNA 分子,包括 MCS 抗生素抗性基因 复制子:来源于大肠杆菌 F 因子 RepE:调节复制复合物在复制位点处组装 par

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