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血清质谱筛查nsclc特异性及egfr-tki疗效相关性多肽的探索性研究-exploratory study on the specificity of serum mass spectrometry in screening ns clc and egfr - tki therapeutic effect related polypeptides.docxVIP

血清质谱筛查nsclc特异性及egfr-tki疗效相关性多肽的探索性研究-exploratory study on the specificity of serum mass spectrometry in screening ns clc and egfr - tki therapeutic effect related polypeptides.docx

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    血清质谱筛查nsclc特异性及egfr-tki疗效相关性多肽的探索性研究-exploratory study on the specificity of serum mass spectrometry in screening ns clc and egfr - tki therapeutic effect related polypeptides

    目录摘要....................................................................................................................1Abstract3前言……………………………………………………………………………6第一部分MALDI-TOF质谱技术在NSCLC早期诊断中的应用研究..............81.1实验材料………………………………………………………..…......….81.1.1试剂…………………………………………………………..………81.1.2实验仪器………………..…………………………………..….….....91.1.3实验对象及标本……………………………………………..……....91.2实验方法…………………………………………………..……………..101.2.1血清采集、磁珠提取多肽及质谱检测……………….………….....101.2.1.1标本收集步骤……………………………………..……….…...101.2.1.2金属螯合磁珠处理血清样品的步骤…………………..……....101.2.1.3点靶及质谱检测……………………………………..…….…...111.2.2分析…………………………………………………...….………....111.2.2.1生物信息学软件ClinProTools2.1介绍………………….……111.2.2.2分析过程……...…………………………..…………..………..131.3实验结果………………………………………….…………………...…131.3.1训练组的血清多肽指纹图谱………………....…………………….131.3.2训练组的血清差异多肽结果分析………………………………….151.3.2.1肺癌相关差异表达多肽的发现………….…………………….151.3.2.2NSCLC分类模型的建立………………………….……...……161.3.3盲法鉴定…………………………….…….……….……………….171.4讨论…………………………………...………………………………….181.5结论…………………………………….…………………...…………...211.6参考文献………………………………………………….......................21第二部分晚期NSCLC血清多肽与EGFR-TKI疗效的相关性分析……..…232.1实验材料…………………………………………………………......….232.1.1药物及试剂……………………………………………………...….232.1.2实验仪器………………..…………………………………….….242.1.3实验对象及标本………………………………………………....242.2实验方法…………………………………………………………………242.2.1血清采集、随访、磁珠提取多肽及质谱检测…….………...…....252.2.1.1标本收集步骤……………...………………………..…….…...252.2.1.2患者随访…………………………………………..…………...252.2.1.3金属螯合磁珠处理血清样品的步骤……..……................…...252.2.1.4点靶及质谱检测...…………………………..................…..…..252.2.2分析…………………………...………………………….………....262.2.2.1生物信息学软件介绍………………….………….……..……..262.2.2.1.1ClinProTools2.1软件……………...…..….....….…..……..262.2.2.1.2FlexAnalysis3.0软件………………….....….……….……272.2.2.1.3NCBA6.0软件……………...………….....….……….…272.2.2.2分析过程……...………………………………..……..………..282.3实验结果……………………………………………….…………...……282.3.1入组患者临床特征资料…………………….……..……………….282.3.2NSCLC患者血清多肽质谱检测结果...…………….……..……….292.3.2.1训练组的血清差异多肽结果分析………….……..…………..302.3.2.1.1训练组的血清多肽指纹图谱.……...…….....….…..……..302.3.2.1.2疗效相关差异表达多肽的发现…...….….....….…..……..312.3.2.1.3建立模型……...

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