靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测分析和验证.pptVIP

靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测、分析和验证 解放军总医院南楼血液科 卢学春 杨波 朱宏丽等 生物信息学在全球迅猛发展 如何利用数据库为我们服务？ ID4丢失对白血病治疗前景的启示 哪些药物能够诱导ID4基因的表达？ ID4基因的启动子分析 ID4基因启动子活性分析 ID4基因5′侧翼区顺式作用元件的预测结果 ID4基因表达谱的生物信息学预测 雌激素对ID4基因表达的影响 a. C57BL/6小鼠卵巢切除后的胸腺用17β-雌二醇（E2）或E2的类似物三羟基异黄酮处理. b. 卵巢切除14天后，小鼠皮下注射黄体酮，在不同时间点切除子宫检测 对ID4基因表达具有促进作用的因素 a.3日龄小鼠用ATRA处理.在第4天给一半小鼠以地塞米松（DEX）. b. 额叶皮质的基因表达，取自过表达人类乙酰胆碱酯酶（AchE）的雌性小鼠和雌性FVB/N小鼠. C. 巨噬细胞和脐静脉内皮细胞用100nM白三烯处理1小时后的基因表达. d. 来自骨髓的巨噬细胞PIAS1用500U/ml的IFN-β或10ng/ml IFN-γ处理2h或4h. 二丁酰环磷腺苷钙对MOLT4白血病细胞系表达ID4基因的影响 DL2000为DNA分子量标准；M4为不做任何处理的MOLT4细胞系，M4-DC浓度为0.1mmol/L的二丁酰环磷腺苷钙处理48h。ID4基因的PCR产物长度为364bp。内参hHPRT的产物长度为231bp。 * 基因→基因组学 蛋白质→蛋白质组学 表观遗传学→表观基因组学 疾病状态的…… 生物信息学！ 表观遗传学的贡献 抗癌基因的丢失与肿瘤的发生密切相关 ID4基因的表达缺失而非突变与白血病和淋巴瘤的发生密切相关 重新表达！ 转染-基因治疗 药物诱导 生物信息学可以预测！ 实验室证实 -873, -871 NR, -283 CACC-binding factor +107, +127, +133, +194 EGR2 +105, +131, +46 HiNF-C +46, +102, +105, +131, +124 WT1 -KTS +44, +133, +160, +177 GCF 负向调控 -244，-214，-181，-155，-129，-68，-28 ERE -301，-267 CRE/half -291, -249, -80, -32, +34, +53, +61 Zeste -355NR, -148, -106 GR -705, -369, -572, -253, -108 C/EBPalpha -794NR, -498, -424, -419, -350, -157, -4 abaA -901N, -872NR, -867, -559, -369, -283, -187, -118, -91, -58, +14, +17, +45, +47, +48, +78, +81, +91, +94, +1004, +1006, +1007, +1011 +124, +130, +132, +133, +134, +173, +191, +193, +194, +231, +233, +235, +236, +259, +260 Sp1 -903, -621, -441, -374, -149,-136, -606 NR c-Myb 正向调控 位置 顺式元件 调控区 对ID4基因表达具有抑制作用的因素 a.肺组织取自100％氧损伤的野生型Nrf2敲除小鼠. b.用100uM ZVAD处理REtsAF-Bcl-2细胞，并在39.5℃条件下培养使caspases失活. REtsAF-Bcl-2细胞带有温度敏感的LT抗原突变体，能够在33℃而非39.5℃条件下抑制p53基因的活性. c.脊髓组织， 200ng的二羟维生素D3对多发脊髓硬化B10PL小鼠基因表达的影响. d. 比较对Sindbis病毒具有抗性和敏感性293细胞的基因表达 有关ID4基因表达调控的文献 E-box (+) GA (-) DNA sequence Pagliuca A, 1998 J-Biol-Chem 7 cAMP(-)* mouse forebrain astrocytes Andres BPJ, 1999 Exp-Cell-Res 6 FSH and cAMP(+)* Sertoli cell line Chaudhary J，2001 Endocrinology 5 E-box binding factor and c-Myc-binding protein(-) WI-38 fibroblast Semov A，2002 Anal-Biochem 4 Methylati