小分子物质结构与熔点及卵白亲和性定量构效关系研究.pdfVIP

摘要 面对海量的数据以及科学家们对化学知识规律的不断需求，产生 了化学信息学这一门新的学科。针对化合物熔点性质和生物活性，本 文从下面几个方面展开化学信息学中的QSPR／QSAR研究工作： 第一章对现今可利用的数据库基本情况进行基本说明。 第二章则对两组数据进行了比较讨论，试图说明在QSAR／QSPR 研究中经常碰到的一个基本问题。结果表明LLR(局部模型)对于结 构散布度很大的分子结构多样化的大样本数据没有效果；但是对于散 布度较小且均匀的数据集，LLR局部模型能充分表达近邻分子所包含 的特殊结构特征与分子性质之间的关系，显示良好模型结果。 物结构与熔点性质和蛋白质亲和性之间的关系进行了讨论。文中同时 采用新近提出的电性距离矢量、三维全息原子场作用矢量以及分子比 较场方法针对41个黄酮类物质的GABAA蛋白受体亲和能力，建立 了2D、3D．QSAR模型，模型结果表明，新发展的描述子能良好地表 征分子的结构信息，建立稳定的QSAR模型。同时表明2D模型好于 3D模型。 第四章采用两种结构相似性聚类筛选分析方法对结构多样性丰 富的似药小分子数据库中的化合物进行筛选然后进行QSPR建模，对 于筛选出的某一类化合物数据集，其模型结果优于文献采用人工神经 网络方法建模。 第五章则针对物质相似性问题，提出了一种基于性质的同系物结 构相似性度量的概念和方法。文中指出，对于不同的性质的同系物， 其分子结构的相似度是不同的。 关键词定量构效关系，局部模型，全局模型，分子比较场，分子结 构相似性 ABSTRACT Tomeetthe needsofchemical from scientists’increasingknowledge data comesin． large—scalesets，Chemoinformatics This Was as organized paper following： the Thefirst indroducedthemaindatabaseswhichincluded chapter Chemicalandthe databases． Biological Inthesecond datasetswere witheachotherto chapter,two compared illustrateabasic intheresearchfieldof problemappeared QSAR／QSPR often．AnewmethodoflOCal whichobtainsa mLK 1azyregression fora moleculeitslocal than predictionquery using neighborhood，rather thewholedata usedto to theeffectof considering set)Wastry improve that resultshowedLLRcould thelocalfeatures prediction．The