大黄有效成分的提取分手和低聚DNA溶液构象的NMR研究.pdfVIP

摘 要 IDNA的溶液构象可以用核磁共振方法获得，这也是目前能够观测到DNA溶 液三维结构的唯一方法。药物与DNA!的相互作用将会抑制DNA的转录与复制， 用NMR方法研究药物与DNA的复合物可以直接解释药物与生命物质的作用机 制，有非常重要的生物学意义．我国有丰富的中药资源，通过核磁共振技术， 我们能从分子水平上阐明中药与DNA相互作用的机制，并获得复合物在溶液中 三维结构的详细信息，对中医中药事业的进一步发展将会起到很大的推动作 用。因此找们选取了几种报道有抗癌功效，并被证明与核酸发生作用的中药 材，提取出它们的有效成分，作为与DNA作用的研究对象，用核磁共振方法探 测它们与DNAfl自结合模式以及xJDNA模板的选择性，获得药物与DNA作用的 三维图象。≯V一 大黄所含的成分是蒽醌类化合物，与DNA夹嵌物蒽环抗生素有相同的母体 结构，而且有报道证明大黄的有效成分可以与DNA发生作用。我们推测它们可 能也采取夹嵌式嵌入DNA的相邻碱基对之间，形成复合物。为此，我们提取了 大黄的主要成分，令其与水溶液中的DNA相作用。通过分离我们获得了甙元大 黄酚、太黄素和芦荟大黄素，并测定了它们的结构。 针对大黄，我们合成了一个自补型的10聚脱氧核糖核酸片断 d(TATGcGcATA)2。利用二维NOE实验实现了质子化学位移的归属，并由交叉 峰强计算出质子间距作为约束条件，为今后用分子动力学进一步确定该序列的 溶液三维结构奠定了基础．实验得到的NOE距离约束对A链和B链同时加入，共 有NOE约束332个，其中172个残基内质子间距，132个残基间质子间距，28个链 间质子间距。实验观察到该核苷酸的糖苷键呈反式构象，糖环以C2-endo构象为 主，确定链间形成了稳定的氢键作用，整个分子构成右手双螺旋结构。还观察 到溶剂中的EDTA与5’一端T1有明显的相互作用． 关键词： 核磁宾丞，，DNA溶液兰矗结构，大薰d(TAT蒎cATA)：，质拿k v ／ 学位移，NOE距离约束 ABSTRACT in beobserved ’fhethree—dimensionalstructureofDNAsolutioncan only by of and Nuclear interaction DNAwill drug Resonance(NM鼬technique．The Magnetic ofthe and ofDNA．Themechanisminteraction inhibilthe replication caa transcription be the NMR ofdrug—DNAusing explaineddirectlyhy investigation complex technique． ofChinesetraditional Wjmtheabundant1．esource medicine，NMR technique、、rill with themechanismoftraditionalmedicineDNAatmolecularlevel