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Metagenome及其衍生术语中文名探讨 　　摘要：metagenome及其衍生术语对应的中文名至今尚不统一。通过厘清metagenome产生历史及其概念发展，对当前中译名的使用情况进行分析，认为该术语中译名定为“宏基因组”是比较合适的。 　　关键词：metagenome，中文名，宏基因组，元基因组，混杂基因组，偏基因组 　　中图分类号：N04；H059；Q7文献标识码：A文章编号：1673-8578（2015）03-0043-05 　　Abstract： Chinese translation of metagenome and its related terms has not been unified until now. Based on clarifying the history and the concept of metagenome， and using the tools of etymology， we suggest “宏基因组” as its corresponding Chinese translation. 　　Keywords： metagenome， Chinese translation 　　引言 　　人类基因组计划的完成将生物学推向了后基因组时代，诸多新的研究思路不断涌现，新的概念和术语层出不穷，metagenome就是其一，它的出现开启了生物学一个全新的研究方向。然而，metagenome及其衍生术语的中文名至今尚未统一。作为学术交流的基本工具，术语的统一至关重要，不统一会造成交流障碍，甚至在文献检索时出现偏差。因此，笔者将以metagenome为核心，在厘清其产生历史及概念发展的基础上，借助词源学等分析，对metagenome及相关词的中文名进行探讨。 　　一 metagenome产生历史及概念发展 　　在自然界中，数以亿计的生物彼此相互依存、相互制约，处于共生共存的动态平衡中。我们要想更准确认识生命的起源、本质、进化等问题，更清晰了解生物之间的相互作用，就必须考虑周围环境（包括环境中的生物）对生物体的影响。在动物及人体中，消化道内存在大量微生物，一个正常人肠道内的细菌总量可以达到1014个 [1]，比人体细胞总数都高出一个量级，这个群体称之为肠道菌群。早期研究表明，这些肠道微生物与人体健康密切相关。 　　对自然环境或人体肠道中这些彼此密切相关的生物群体进行的研究，超越了传统意义上单一物种的研究，其对象更为复杂。采用传统方法对所有微生物进行分离、培养测定基因组，显然是不现实的。因为目前人们对微生物的认识还非常有限，能够在实验室内人工培养的微生物仅占自然界微生物种类的1%，也就是说还有99%的微生物菌群，是无法通过分离纯化的手段来研究微生物基因组的。因此，对环境或人体微生物整体的研究逐渐步入研究者视野。 　　1991年，环境基因组学（environmental genomics）的概念被首次提出[2]，并在同年构建了第一个通过克隆环境样品中DNA的噬菌体文库 [3]，环境基因组学的研究开始受到广泛关注。1998年，美国国立卫生研究院正式启动了环境基因组计划（environmental genome project， EGP），标志着生命科学从单一物种研究走向了以全部相关生物基因组总体为研究对象。1998年，新名词metagenome被首次提出 [4]，并将其定义为生物环境中全部微小生物遗传物质的总和，提出针对特定环境样品中细菌和真菌的基因组总和进行研究这一概念，指出应用这一新的组学方法研究微生物复杂群落基因组将成为快速发展的领域。 　　随着基因组学的迅速发展以及人们在微生物领域的广泛研究与应用，metagenome越来越为人们所熟识。广义上，metagenome指特定环境下所有生物遗传物质的总和，主要强调微生物整体的群体性。狭义上，metagenome主要是以特定环境（自然环境和人体环境）中的细菌和真菌基因组DNA为研究对象，针对所有可培养和不可培养的微生物的遗传物质，通过克隆表达等方法研究基因功能，从而揭示相互作用的规律。 　　近年来， metagenome研究已经渗透到各个领域，其研究的环境对象越来越广泛，包括：海洋、湖泊、河流、土壤、高温/低温环境、人体口腔环境以及人体或者动物胃肠道等。相关的研究成果也在医药健康、环境保护、新型能源、农业科学等多方面得以推广。 　　二中译名使用现状分析 　　metagenome研究在中国开展以来，在发表的中文论文以及论著中，其中译名主要有“宏基因组” “元基因组” “超基因组” “混杂基因组” “偏基因组”等，metagenomics、metatransciptome、metatranscriptomics则相应地