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武陵山区玉米地方品种核心种质遗传多样性与评价
武陵山区玉米地方品种核心种质遗传多样性与评价
摘要:田间试验结合微卫星(SSR)标记技术,从表型和DNA分子水平分析评价了武陵山区玉米(Zea mays L.)地方品种核心种质的遗传多样性。结果表明,核心种质在14个农艺、经济性状上存在极显著差异;基于SSR标记的UPGMA聚类能有效区分玉米地方品种核心种质,50对SSR引物在核心种质中共检测到275个多态性位点,各引物检测到的等位位点数3~15个,平均为6.0个;Shannon多态信息量为0.29~0.83,平均为0.75。核心种质代表性评价结果表明核心种质较好地保持了原种质库的遗传变异。
关键词:玉米(Zea mays L.)地方品种;核心种质;遗传多样性;武陵山区
中图分类号:S513;Q789 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2014)07-1506-03
Genetic Diversity and Evaluation of the Core Germplasms of Maize (Zea mays L.) Landraces from Wuling Mountain Area
YAO Qi-lun,CHEN Fa-bo,FANG Ping
(Department of Life Sciences and Technologies, Yangtze Normal University, Chongqing 408109, China)
武陵山区包括重庆、湖南、湖北、贵州四省(市)的部分地区,属典型的丘陵、山区地带。由于该地区复杂的地形地貌及多变的气候生态环境,部分山区农户仍种植适应本地区生态环境要求的玉米(Zea mays L.)地方品种。玉米地方品种作为一种重要的植物种质,是玉米育种的物质基础[1-3]。
随着武陵山区玉米地方品种征集数量的增加和种质资源库变大,对这一种质资源的管理成本和利用难度也相应增大。因此,构建武陵山区玉米地方品种核心种质,使少量的核心种质保存丰富的遗传变异,是保护与利用武陵山区玉米地方品种的有效途径。
1 材料与方法
1.1 供试材料
基于玉米地方品种的地域分布和种质特征,按16%的抽样率,从武陵山区376个玉米地方品种资源库中选取60个玉米地方品种作为供试材料。 1.2 试验方法
1.2.1 田间试验设计 田间试验采用随机区组设计,3次重复,单行区,每行20株,密度5万株/hm2。
1.2.2 农艺、经济性状考查 以单株为单位调查主要农艺、经济性状:株高、穗位高、抽丝期(播种至吐丝天数)、散粉期(播种至散粉天数)、全生育期(播种至成熟天数)、总叶数、穗长、秃尖长、穗粗、穗行数、行粒数、穗粒重、百粒重和容重。
1.2.3 基因组DNA提取与PCR扩增 以玉米幼苗叶片为材料,抽取并纯化基因组DNA。从782对引物中筛选50对带型清晰、具有明显多态性的引物,对所有样品进行PCR扩增,用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳检测扩增产物。其中反应程序为:95 ℃预变性5 min;95 ℃变性40 s,65 ℃退火40 s,72 ℃延伸1 min,共30个循环;72 ℃延伸2 min。采用0,1数据表记录结果。
1.2.4 数据分析
1)农艺、经济性状的方差分析。对考查的表型性状指标作方差分析,检验核心种质各农艺、经济性状差异的显著性,结合变异系数分析其表型差异。各项数据采用DPS 3.01软件统计分析。
2)SSR数据分析。利用NTSYS-pc2.1软件,计算遗传相似系数(GS)[4]:GS=2Nij/(Ni+Nj),式中Nij为样品i和j都有的带,Ni和Nj分别是样品i和j的所有条带之和,然后用不加权平均法(UPGMA)进行聚类分析。
2 结果与分析
2.1 核心种质表型性状遗传多样性分析
方差分析结果表明,60个核心种质14个农艺、经济性状(株高、穗位高、抽丝期、散粉期、全生育期、总叶数、穗长、秃尖长、穗粗、穗行数、行粒数、穗粒重、百粒重和容重)的差异均达极显著水平,说明表型上核心种质间存在极显著差异;就14个农艺、经济性状而论,除散粉期、穗长和总叶数外,其余性状在区组间差异达显著或极显著水平,表明散粉期、穗长和总叶数受环境因素影响较小。株高、穗位高、总叶数、抽丝期、散粉期、全生育期、穗长、秃尖长、穗粗、穗行数、行粒数、穗粒重、百粒重和容重的极差分别为110.71 cm、41.53 cm、8.75片、24 d、25 d、29 d、9.84 cm、0.52 cm、2.35 cm、8.40行、12.16粒、64.08 g、31.25 g和453.25 g/L;从变异系数看,穗粒重的变异系数最大(56.73%),其次是全生育期(5
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