猪胞内劳森氏菌lscN基因克隆及序列分析.docVIP

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猪胞内劳森氏菌lscN基因克隆及序列分析

猪胞内劳森氏菌lscN基因克隆及序列分析   摘要:胞内劳森氏菌是猪增生性肠炎的病原,试验设计4条引物,采用半巢式PCR从目的DNA中扩增出1 317 bp的胞内劳森氏菌lscN基因,并进行序列分析。结果表明,lscN与GenBank中PHE/MN1-00、N343同源性为99%,是劳森氏菌三型分泌系统组件的编码基因。   关键词:胞内劳森氏菌;三型分泌系统;PCR   中图分类号:Q785 文献标识码:A 文章编号:1007-273X(2017)12-0010-02   猪增生性肠炎(Porcine proliferative enteropathy,PPE)是由劳森氏菌(Lawsonia intracellularis,Li)感染引起的猪接触性肠道传染病[1]。该病主要发生在6~20周龄断奶猪,育成猪也可感染,引起顽固性腹泻,严重降低饲料转化率,导致养猪业受到经济损失[2]。三型分泌系统(Type Three Secretion System,TTSS)是一种跨细菌内外膜、细胞外空间和宿主细胞膜的蛋白运输装置,在革兰氏阴性菌中广泛存在,现已发现存在TTSS的致病菌包括大肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、耶尔森氏菌等[3]。英国学者David G.E. Smith 在2009年运用染色体步移技术在Li分离株中鉴定到编码TTSS的基因区域,其中lscN是为效应蛋白跨膜提供能量的ATP酶[4],因此,本试验对lscN进行克隆及序列分析,为后续LscN蛋白的研究奠定基础。   1 材料与方法   1.1 材料   1.1.1 主要试剂 PCR LA Mix、PCR Taq Mix、2 000 bp Marker、T4 DNA ligase、pMD18-T simple载体、DH5α感受态细胞、GoldenView、琼脂糖购自宝生物工程(大连)有限公司;Tris、EDTA-Na2、NaCl、LB培养基由龙岩学院生命科学学院动物医学系提供。   1.1.2 引物 从GenBank中下载lscN(LI_RS02940)的序列,使用Primer Premier 5.0软件设计引物,引物由上海华津生物科技有限公司合成,引物序列见表1。   1.2 方法   1.2.1 PCR扩增 采用巢式PCR扩增目的片段。第一重PCR反应体系为:2×PCR LA Mix 12.5 μL,引物1、2各1 μL (10 pmol/L),模板DNA 1 μL,加灭菌超纯水至25 μL;PCR 反应条件为:95 ℃预变性4 min,95 ℃变性40 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,30个循环,72 ℃延伸10 min。第二重PCR反应体系为:2×PCR LA Mix 12.5 μL,引物3、4各1 μL (10 pmol/L),第一重PCR产物1 μL(100倍稀释),加灭菌超纯水至25 μL;PCR 反应条件为:95 ℃预变性4 min,95 ℃变性40 s,50 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,30个循环,72 ℃延伸10 min。同时设立空白对照。取第二重PCR产物5 μL加入上样缓冲液后进行琼脂糖凝胶电泳。电泳结束后,用凝胶成像仪观察并记录结果。   1.2.2 PCR产物回收 将余下的20 μL PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,在紫外灯下将目的条带从琼脂糖凝胶中切下,放入干净的离心管中称重。向胶块中加入3倍体积Buffer G,50 ℃水浴10 min,其间温和地上下颠倒数次。然后加入1倍体积异丙醇,上下颠倒混匀。向已装入收集管中的吸附柱中加入200 μL Buffer S,12 000 r/min离心2 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。将前面得到的溶液加入到吸附柱中,室温放置2 min,12 000 r/min离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。吸附柱中加入500 μL Buffer G,12 000 r/min离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。向吸附柱中加入650 μL Buffer W,12 000 r/min离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中,空离2 min。将吸附柱放入1.5 mL离心管中,在吸附膜中央加入10 μL Buffer B,室温静置1~2 min,12 000 r/min离心1 min,回收得到目的片段。   1.2.3 PCR产物克隆T载体 取回收目的片段7 μL,pMD18-T载体0.5 μL,T4 DNA ligase 1.5 μL,T4 DNA ligase buffer 1 μL,4 ℃连接过夜。将连接产物5 μL,DH5α 50 μL加入1.5 mL离心管,冰浴30 min,然后42 ℃

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