长江中下游三所城市143例71型肠道病毒基因特征分析.docVIP

长江中下游三所城市143例71型肠道病毒基因特征分析 　　[摘要] 目的 了解长江中下游三城市肠道病毒71型（EV71）基因型的分布状况。方法 利用逆转录半巢式PCR的方法检测三所城市143份临床诊断为手足口病患儿的血清和咽拭子标本。 结果 143份标本中检测到阳性EV71 RNA33份（23%）；经过测序证实33份标本均为EV71 C4型。 结论 三所城市的手足口病主要由C型 EV71病毒引起。不同城市间EV71病毒存在一定的变异。 　　[关键词] EV71；RT-PCR；手足口病；基因型 　　[中图分类号] R373[文献标识码] B[文章编号] 1673-9701（2014）19-0076-03 　　 　　The analysis of genic characteristics of 143 cases of enterovirus 71 in 3 cities of the middle and lower reaches of Changjiang River 　　CHEN Jin1 CHENG Xianfeng1 JIANG Bingfu2 ZHAN Shengwei1 ZHU Ming1 ZHENG Jinxiu1 CHEN Daoli1 　　1.Maanshan Center for Disease Control and Prevention in Anhui Province, Maanshan 243000, China; 2. Medical College of Dongnan University, Nanjing 210009, China 　　[Abstract] Objective To investigate the EV71 genotypes in 3 cities of the middle and lower reaches of Changjiang River. Methods EV71 RNA was detected in 143 samples from the hospitals with reverse translation polymerase chain reaction. Results There were 33 (23%) positive products. After the 33 positive products were sequenced, the results showed that they were all C4 genotype EV71. Conclusion It seems that the HFMDs are mainly infected by the C4 genotype EV71 in these areas. This study indicates that the current C4 genotype EV71 varied significantly in different cities. 　　[Key words] EV71; RT-PCR; Hand-foot-mouth disease; Genotype 　　 　　人类肠道病毒71 型（EV71）属于肠病毒属A型，是柯萨奇病毒A16（CA16）的近亲, 其感染后主要引起手足口病（hand-foot-mouth disease, HFMD）、疱疹性咽峡炎、无菌性脑膜炎及脑炎等临床症状。EV71急性感染还容易造成严重的神经系统疾病，重症病人病死率可达10%～25%，这一点与CA16不同[1]。1997年以来，EV71病毒的流行在亚太地区呈明显上升趋势。其中，1998年和2000年台湾有过两次EV71大流行，分别有129 106和80 677人染病，78、41人死亡[2]。我国深圳2003年也出现EV71暴发疫情[3]，2008年3～4月间我省阜阳市发生儿童感染EV71疫情，死亡总人数达到36人[4]。 　　有研究利用VP1序列的差异对EV71型病毒进行的一项分子流行病学调查发现[5]，EV71型病毒又可分为A、B、C三个亚型。在亚型中，B型和C型又可以分成B1~B5和C1~C5。各地流行的EV71病毒株存在差异，1970年美国加利福尼亚分离出的EV71毒株属于A型；随后，美国、哥伦比亚及澳大利亚等地成功分离出EV71毒株的亚型EB型。1997～2000年，亚太地区流行的EV71属于B3、B4、C1和C2型[6]，而2008年安徽省阜阳市流行的毒株则为C4型。 　　为了了解长江中下游三城市EV71流行毒株的基因型别，我们通过RT-nPCR技术（逆转录-半巢式聚合酶链反应）对143个疑似手足口病的样本的咽拭子标本进行了检测，并对不