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草鱼cyclinG1和Morg1基因的克隆、鉴定及适应性进化分析-微生物学专业论文
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摘要 Y1849850
摘要
本研究从巴构建的草鱼 (Ctenopharyngodon idellus)肝肾 cDNA 文库中克降到 革鱼细胞周期蛋白 Gl 和 Morglo
细胞周期蛋白 Gl(cyclin Gl ,CCNG1) 为非典型性细胞周期索,功能具有复
杂性,不仅参与 DNA 复制还在促进凋亡和信号转导中起作用。革鱼细胞周期蛋 白Gl(cyclin Gl ,CCNGl)全长 cDNA 为 2118 忡。其中 5端非翻译区 255 bp ,3 端非翻译区 963 坤,开放阅读框为 256-1155 坤,编码 299 捕。草鱼细胞周期蛋 白Gl 的N 端 57-143 剧有…高度保守区称细胞周期蛋白盒能识别相应的周期蛋 白依赖的蛋白激酶, C 端 189-261 峭的 EGF Lam 区域可能存在磷酸化位点调节 信号转导。革鱼细胞周期蛋白 Gl 与斑马鱼的问源性为 90%,此外与其他鱼类(大 西洋蛙 Salmo salar ,虹储敛 PoeciUα reticulata) 同源性在 70%以上,与两栖类、 哺乳类的同源性为 40-63% 。系统进化树也显示尊鱼细胞周期蛋白 Gl 与斑马鱼 的亲缘关系最近。
MAPK 组织蛋白 1(Morgl) 是一种分子支架蛋白,通过与 MPl(MEK partner-l)相互作用可影响或调节细胞的生长发育、细胞周期、信号转导等过程。 草鱼 MAPK 组织蛋白 I(Mo咆1)全长 cDNA 为 1402 忡。其中 5端非翻译区 204 bp , 3端非翻译区 241 bp,开放阅读框为205-1161 bp ,编码318 翩。革鱼 MAPK 组 织蛋白 l 含有 7 个 WD40 囊复序列, N 端 22-67 aa 为 Kazal 型丝氨酸蛋白酶抑制 剂区域可调控蛋白酶活性, C 端 228269 倒有泛索脱竣水解酶类僻指区域能协助 完成泛索周期。革鱼 MAPK 组织蛋白 l 与其他鱼类(斑马鱼 Danio rerio 、大西 拌蛙 Salmo salar) 同源性在 90%以上,与两栖类、哺乳类的同源性均在 70% 以 上。系统进化树也显示尊鱼 MAPK 组织蛋白 1 与斑马鱼的亲缘关系最近。
密码子替换模型是检测基因序列单个密码子位点选择作用的统计学方法,能 够有效地检测基因在进化历程中是否受到边择作用,并且可以预测出那些在进化 过程中对功能分化有重要贡献的、受正选择作用的密码子位点。用该模型来分析 cyclin Gl 和 Morgl 的分子适应性,适应性进化分析的结果表明 cyclin Gl 编码蛋. 白的 26A、171A、225K 氨基酸位点受到正选择作用。未发现 Morgl IE选择位点。 关键词:革鱼; cyclin G 1; Morgl; 进化
Abstract
Abstract
Ctenophary吨。don idella cyclin Gl(CCGNl) and MAPK orgnizer l(Morgl) had been cloned 仕om the liver and kideny grass crap cDNA library.
Cyclin G1,the atypical cyclin,has complex functions that not only participates in
DNA replication but also play a role in the promotion of apoptosis and s阳刚 transduction.The fulllengh the grass crap cyclin G1 was 2118bp ,which contained a 5
untranslated region of 255bp and a 3 untranslated region of 963bp.The open reading frame was 256- 1l55bp,which could code a 299 创nino acid polypeptide. N-lobe of
- 创s carp cyclin G1 w础 a highly conserved region called cyclin box which can identify the corresponding cyclin-dependent protein kinase,C-lobe w础 aEGω眨F飞
domain
伽tl1刑at m町ay have ph
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