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房颤生物特征识别与预测研究-生物医学工程专业论文
ENGLISH TITLE OF MASTER THESIS
IDENTIFICATION AND PREDICTION OF BIOLOGICAL FEATURES ASSOCIATED WITH ATRIAL FIBRILLATION
A Master Thesis Submitted to
University of Electronic Science and Technology of China
Major: Biomedical Engineering Author: Feng Ou Advisor: Nini Rao
School : School of Life Science and Technology
独创性声明
本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工 作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地 方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含 为获得电子科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。 与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明 确的说明并表示谢意。
作者签名: 日期: 年 月 日
论文使用授权
本学位论文作者完全了解电子科技大学有关保留、使用学位论文 的规定,有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁 盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权电子科技大学可以将学位论文 的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或 扫描等复制手段保存、汇编学位论文。
(保密的学位论文在解密后应遵守此规定)
作者签名: 导师签名:
日期: 年 月 日
摘要
摘 要
心房颤动(简称房颤)是临床上最常见的心律失常疾病之一,并且具有很高的发 病率和致死率。房颤的发生、发展涉及心房结构重构、心房电生理重构、收缩等 一系列复杂的病理生理机制。房颤进一步可分为阵发性、持续性、永久性等其他 类型,不同类型房颤的病理生理机制也不尽相同。近十年来国内外对房颤发病的 分子生物学机制研究有了长足的进展,然而距离完全揭示其致病机理的差距还比 较大。不断深入基础和临床研究,阐明房颤的发生和发展机制,把治疗房颤的最 佳方案建立在对其发生/发展机制的充分理解之上是目前在心律失常领域中亟待解 决的问题之一。
本文针对永久性房颤和房颤伴瓣膜性心脏病的高通量表达数据进行挖掘和分 析,识别两类疾病相关的新生物特征,为开展实验研究和改进房颤病理生理机制 的理解提供理论依据和指导,主要研究内容如下:
1.识别与分析永久性房颤的差异表达基因。采用非对称主成分分析算法 (Asymmetric principal component analysis,APCA)算法,本文从永久性房颤疾病与对 照组的基因表达数据中提取了 51 个永久性房颤相关的差异表达基因,再通过基因 富集分析筛选与房颤病理因素相关的基因作为最终永久性房颤相关的特征基因。 最后,我们筛选了 32 个房颤相关的新特征基因,为房颤的病理生理机制研究提供 了新视线。
2.预测房颤伴瓣膜性心脏病的 miRNA 生物标记。采用 APCA 算法,本文提 取了 52 个房颤伴瓣膜性心脏病与对照组的差异表达 miRNA ,随后通过 miR2Disease 数据库的搜索发现 15 个 miRNA 与房颤的病因疾病相关。我们的研究 结果为房颤的防治和房颤与其独立危险因素之间的纽带提供了新的潜在靶点,对 深入理解房颤的分子机制有着重要意义。
关键词:房颤,非对称主成分分析,差异表达基因,分子机制,小 RNA(miRNA)
I
ABSTRACT
ABSTRACT
Atrial fibrillation(AF) is the most common type of cardiac arrhythmia, and is responsible for substantial morbidity and mortality in the general population. The outstanding progresses have shown that AF pathophysiology involves electrical, structural and contractile remodeling. There are many different types of AF, for example paroxysmal, persistent, or permanent AF. The pathophysiological mechanism of different AF type is different. In the
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