发育性青光眼家系的分子遗传学分析-生物化学与分子生物学专业论文.docxVIP

英文缩写一览表 英文缩写 TIGR 英文全称 trabecular meshwork induced glucocorticoid response 中文全称 小梁网糖皮质激素诱导反应 COCH vWFA Coagulation factor C Homology von Willebrand factor A-like 凝集因子 C 同源体 非胶原结构糖蛋白 A 型 PCR SNP A T G C DNA Polymease Chain Reaction single nucleotide polymorphisms adenosine deoxythymidine guanosine cytosine deoxyribonucleic acid 聚合酶链反应 单核苷酸多态性 腺嘌呤核苷,腺苷 脱氧胸腺嘧啶核苷,脱氧胸苷 鸟嘌呤核苷 胞嘧啶核苷 脱氧核糖核酸 bp POAG min OD rpm s P L base pair Primary Open Angle Glaucoma minute Optical Density round per minute second proline leucine 碱基 原发性开角型青光眼 分钟 光密度值 每分钟转数 秒 脯氨酸 亮氨酸 S T V SSCP serine, Ser threonine, Thr voltampere singal strand conformation 丝氨酸 苏氨酸 伏安 单链构象多态性 polymorphism 发育性青光眼家系的分子遗传学分析 硕士研究生 孙静静 导 师 刘旭阳 教授 摘 要 目的 对四川地区一个发育性青光眼家系进行详尽的分子遗传学分析，查找其可能的 致病基因。 方法 收集发育性青光眼家系成员的临床资料，并根据孟德尔法则进行详尽的遗传学 调查分析。提取所有样本的基因组 DNA，聚合酶链反应扩增 TIGR 基因的 3 个外显子 和 COCH 基因 vWFA 结构域所在的第 8~12 号外显子，以及部分外显子周围的内含子 序列。对家系中所有成员的 PCR 产物进行直接测序。将所有成员的测序结果在 NCBI 网站上与野生型序列进行“blast”序列比对分析。 结果 （1）该家系可追踪到的有三代共 13 人，男性 8 人，女性 5 人。其中确诊为的 青光眼的患者 6 例，男性患者 4 人，女性患者 2 人。家系中连续 3 代发病。（2）在所 有青光眼患者中均发现一个位于 TIGR 基因第 3 外显子内的 Pro370Leu 杂合突变，此 杂合突变仅在全部患者中存在，而正常成员中均不存在。此外还发现 3 个 SNP，分别 为在 TIGR 基因的第 2 外显子下游第 35 个碱基 G→A 改变；在 COCH 基因第 11 外显 子内 C→G，导致 Ser352Thr 的改变；在 COCH 基因第 11 外显子下游第 9 个碱基 C→A 改变。 结论 本课题首次在发育性青光眼家系中发现 TIGR 基因 Phr370Leu 突变，该突变在 患者中均存在而在正常成员中均不存在强烈提示该突变为该家系的致病基因，但该家 系是否为 TIGR 基因的单基因致病，是否存在其他已知或未知新基因协同致病仍需进 一步的研究证实。COCH 基因不是该家系的致病基因，提示该基因可能与其他类型的 青光眼存在相关性。 关键词 发育性青光眼；家系；TIGR；COCH Molecular genetic analysis of a family with developmental glaucoma Abstract Objective To determine the causative gene in a Sichuan pedigree with familial developmental glaucoma. Methods Analyze the genetic form of the pedigree according to Mandalian hereditary rules after we collect a family with developmental glaucoma. The genomic DNA was extracted from the peripheral blood of all samples. All coding 3 exons of TIGR gene and exons 8-12 of cochlin gene were amplified by PCR using the sequence-specific primers. Automated sequencing method was used to scree