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儿茶素与DNA碱基相互作用的理论研究-有机化学专业论文
位点。为了进一步研究复合物的成键特征,我们分别应用了分子中的原子理
论(AIM)和自然键轨道理论(N BO)对所有复合物的键临界点电荷密度的拓扑 性质进行了分析。通过我们的研究结果表明:
(1) 儿茶索和 DNA 碱基会按照尽可能多的形成氢键相互作用这种几何优势来 降低儿茶紫.DNA 碱基复合物体系的能囊,从而使其达到最稳定状态。盘 键对儿茶素 .DNA 碱基复合物的稳定性起着囊要作用,并且形成的稳定发 合物中含有两个或更多氢键,其中儿茶素和 DNA 碱基分子既是氯键供体 又是氢键受体。
(2) 儿茶索.DNA 碱基复合物存在丑种不间类型的氯键: N-H...O、OH-...O、
O-H...N、C-H...O 和 C-H...N,其中C-H...O 和 C-H...N 氧键的强
度较弱,含此类氢键的复合物的稳定性相对较差。
(3) 儿茶索与 DNA 碱基相互作用的结合能顺序为 z 儿茶索·胞周密晓〉儿茶絮,腺嚓 岭〉儿茶索幽鸟嘿岭〉儿茶素胸腺晴晓。
(4) 儿茶素分子与 DNA 碱摹结合最稳定的是经基 04_H10 和 03_H6 位。 关键词:儿茶素密度泛踊理论鸟嘿岭腺喋岭胞嘈晓胸腺周密咙
11
Theoretical Study on 白e interaction between Catechin and DNA bases
Major: Organic C主臼笠istry
Graduate Student: Wan-Fei Cai Supervisor: Prof.Lai-Cai Li
h 也.e recent y臼rs,li臼earch on 也.e interaction between micromolecule and biomacromolecules is one of fields which 也e scientific res臼rch personnel being
o∞upied in 也e various 挝nds of domains such 部 chemis町 biology,and medicine
are interi岱ted 坦.DNA is one of the 题。stim雪。此组t biomacromolecul 筐, which 扭曲e 臼rrier of 也e load of medicine and transfer of information. The interacting mechanism ,moleαlar r,民ogni岳on 组d s吨uence-dependent 恒.termolecular
interaction betw出n 也e mi町omol∞ule and macrobiomolecul 部缸e 部pecially
import植t. Catechin is one of 也e important polyphenols ∞mpounds w坦ich own
many biological and pharmacological activities including antioxidant,姐ti- inflammatory and 但.ti-tumor e:ffi民缸 Howev筐,也e 担.teract垣g mechanism of the
catechin and DNA bases is not c1岱rdueto ex严rimen创∞nditions.
on the basis of 函。ve the importance of 由ese is副部,也e interacting pa忧erns and mech缸拉回1 of 也e catec主in and DNA 单路岱 have 单民n investigated us血g 也e density 如nctio时也倒yB3LYPme仕lodwi白6-31+G* b部IS.
The 盟ain ∞nten组 of 也is paperare 部 follows:
(1)We optim泣ed 也e different hydroxyl orien组岳ons isomers of 臼techin and fo眩 bas臼 about DNA us部g 也e density functional 也eory B3LYP method wi也
6-31+G* b部is. We get five differ.t hydroxyl orientations isomers of catechin, andch∞se 也eop垃盟izeds民d缸eofthe neu位al catec屈nwi也也e lowest 钮ergy.
The geometric p缸
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