蛋白磷酸化对Kv通道调控机制的影响-理论物理专业论文.docxVIP

，进行研究工 ，进行研究工作所取得 何他人或集体已经发表 对本论文所涉及的研究 。本学位论文原创性声 原创性声明 的学位论文，是本人在导师指导下 用的内容外，本学位论文不包含任 为获得其他学位而使用过的材料。 集体，均已在文中以明确方式标明 日期： 位论文版权使用授权的说明 大学关于收集、保存、使用学位论文的以下规定：学校有 字化或其它手段保存论文；学校有权提供本学位论文全 学校有权将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库 国家有关部门或者机构送交论文的复印件和电子版。 密后适用本授权说明） 日期： 本人郑重声明：所呈交 的成果。除文中已经注明引 的作品内容，也不包含本人 工作做出贡献的其他个人或 明的法律责任由本人承担。 学位论文作者签名： 关于学 本人完全了解河北工业 权采用影印、缩印、扫描、数 文或者部分内容的阅览服务； 进行检索、交流；学校有权向 （保密的学位论文在解 学位论文作者签名： 导 师 签 名： 日期： 河北工业大学硕士学位论文 河北工业大学硕士学位论文 蛋白磷酸化对 蛋白磷酸化对 Kv 通道调控机制的影响 蛋白磷酸化对 Kv 通道调控机制的影响 摘 要 本文首次采用同源模建、分子动力学模拟和 Targeted MD 相结合的研究方法，综 合考虑蛋白磷酸化和 Kv2.1 通道门控构象变化，研究了 Tyr124 的磷酸化对 Kv2.1 通道 门控动力学过程的调节机制，获得了一些有价值的结果： 1． S4 螺旋在去极化电压下向膜外侧移动是诱发电压门控型钾通道开放的源动力。我 们的研究结果首次表明 Tyr124 的蛋白磷酸化通过增加 Kv2.1 通道蛋白中的主要电压 感受器 S4 螺旋蛋白柔性，使得 Kv2.1 通道电压感受器 S4 螺旋更容易发生移动。 2． 作为电压感受器和孔道螺旋的连接部位，S4-S5 linker 在 Kv 通道门控构象变化中 起着重要作用。我们的研究结果表明 Tyr124 的蛋白磷酸化降低了 S4-S5 linker 的蛋 白柔性，这使得 S4 螺旋构象变化更容易传递到成孔螺旋 S5、S6 上，从而对 Kv2.1 孔道的构象变化起到了积极作用。 3． 我们的研究结果表明以 S4 螺旋和 S4-S5 linker 同时作为靶子的 TMD 使得通道的开 放程度更大，这也从侧面证明了 S4-S5 linker 在 Kv 通道门控构象变化中的重要作 用。 4． Tyr124 的蛋白磷酸化同时增加了 S6 螺旋上 Leu403-Leu407 蛋白柔性降低了 Asn415 -Tyr420 蛋白柔性，即 S6 螺旋靠近细胞质的部分更容易发生移动，使 Kv2.1 通道蛋 白的孔道开放/闭合所需能量更少。这与实验观测到 Tyr124 的磷酸化使得 Kv2.1 通 道 IV 曲线左移，通道更容易开放的实验结果相一致。 虽然我们结合 MD 和 TMD 模拟方法，对 Tyr124 的蛋白磷酸化调节 Kv2.1 通道门 控机制进行了初步探索，得到了一些有意义的结果，但是我们的研究也还有不足之处， 即 TMD 模拟过程并没有完全使处于关闭构象的通道转换为开放构象。我们考虑可能 是由于模拟时间不够，或者我们在模拟过程中考虑的“靶子”（即主动诱发通道变化 的关键氨基酸序列）不够全面所致。我们希望本文的研究为今后人们研究电压依赖性 i PAGE PAGE iv iii iii 钾离子通道的门控动力学过程，以及磷酸化调节 Kv 型通道门控的微观机理提供了一 种有益尝试。在将来的研究中对这一方法的实施作进一步的完善。 关键词：Kv2.1 通道，蛋白磷酸化，靶向分子动力学模拟 MOLECULAR MECHANISM OF PHOSPHORYLATION-DEPENDENT REGULATION OF KV CHANNELS ABSTRACT For the first time, the author combined the homology modeling, molecular dynamics simulations with Targeted MD and studied the gating dynamics and conformation changes induced by the phosphorylation of Tyr124 in Kv2.1 channel. The main conclusions are as follows: The outward movement of S4 helix is critical to Kv channel gating which is induced by depolarizing membrane potential and trigger