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陆地棉产量纤维品质性状与ssr标记的关联分析种业专业论文
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关于学位论文原创性和使用授权的声明本人所呈交的学位论文,是在导师指导下,独立进行科学研究所取得
关于学位论文原创性和使用授权的声明
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论文作者签名:控丝
导师签 名:赴
日
万方数据
英文缩略表
英文缩略表
万方数据
目
目 录
中文摘要 . ..I
Abstract . . II
1引言 .1
1.1棉花的遗传多样性 .1
1.1.1遗传多样性的研究方法 一1
1.1.2遗传多样性的研究进展 一3
1-2关联分析 .4
1.2.1关联分析的基础 .4
1.2.2连锁不平衡的度量 一4
1.2.3关联分析的优势 一5
1.2.4关联分析的方法及策略 。5
1.2.5关联分析的影响因素 一6
1.3植物中关联分析的应用 .7
1.4关联分析在棉花上的应用 .9
1.5本研究的目的意义 10
2材料与方法 .10
2.1植物材料 10
2.2材料种植 一1 1
2.3表型性状测定 一1l
2.3.1产量及农艺性状 11
2.3.2纤维品质的测定 1 1
2.4 DNA的提取 。14
2.5 SSR扩增及扩增产物检测 16
2.5.1 SSR引物的选用 16
2.5.2 SSR反应体系及扩增程序 16
2.5.3电泳 .17
2.5.4银染 . 17
2.6数据分析与统计 1 8
万方数据
3结果分析
3结果分析 ..19
3.1性状的方差分析和描述性统计 19
3.2相关性分析 1 9
3.3引物筛选及遗传多样性分析 26
3.4聚类分析 26
3.5群体结构分析 27
3.6性状和标记的关联分析 ..30
3.7表型效应分析及优异等位变异发掘 32
4讨j跄 ..44
4.1群体结构与关联分析 44
4.2表型性状与标记的关联分析 45
4-3优异关联位点及等位变异 ..46
5结论 一47
参考文献 48
致谢 53
攻读硕士学位期间发表的学术论文 .54
Il
万方数据
山东农业大学硕士学位论文中文摘要
山东农业大学硕士学位论文
中文摘要
棉花是我国重要的天然纤维作物。提高产量、改善品质是棉花育种的重要目标。发 掘与产量和纤维品质关联的分子标记,对于提高棉花育种效率具有重要意义。本研究开 展了陆地棉产量和纤维品质性状与SSR标记的关联分析,以期发掘与重要性状关联的分 子标记和重要的等位变异及优异种质资源,为棉花分子标记辅助育种提供依据。主要结 果如下:
1.对209份供试材料进行了2年的表型鉴定,发现性状的变异系数范围为 O.89%.23.59%,平均变异系数为7.45%。结果表明供试材料在14个产量和品质性状上 具有较大的表型多样性。
2.利用218对SSR引物进行了遗传多样性分析,在209份材料中检测到841个等 位变异,平均单个引物检测到3.86个等位变异。平均基因多样性指数为O.45,多态信息 含量(PIC)的变异范围O.02.0.75,平均为O.38。表明材料问在分子水平具有有丰富的遗
传多样性。
3.通过STRUCTURE 2.3.1软件进行群体结构分析,将209份供试材料划分到 POP.1、POP.2和POP一3三个亚群,分别包含44份、72份和93份材料。基于Nei的遗 传距离的聚类分析也将209份材料划分为三个亚群,与群体结构分析结果具有一致性。
4.基于GLM模型的关联分析,共检测到与14个性状相关联的位点167个,其中
64个与产量相关性状相关联,103个与纤维品质性状相关联。在这些位点中,45个SSR 位点同时与两个或两个以上的性状显著相关联。
5.对稳定关联的标记位点进行了优异等位基因分析,发掘出一批优异等位基因位 点和携带这些优异等位基因的载体材料。研究结果为进一步开展棉花产量和纤维品质的 精细定位、分子标记辅助育种提供参考。 关键词:陆地棉;产量;纤维品质;SSR;关联分析
万方数据
陆地棉产量、纤维品质性状与SSR
陆地棉产量、纤维品质性状与SSR标记的关联分析
Abstract
Cotton is arl important natural fibre crop in
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