基于表达谱和小RNA测序的南瓜不同盐响应机制的研究-设施园艺学专业论文.docxVIP

学位论文是否保密 学位论文 是否保密 否 如需保密，解密时间 年 月 日 栅＼嘲魁 本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的 研究成果．尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含 其他人已经发表或撰写过的研究成果。也不包含为获得华中农业大学或其他教 育机构的学位或证书而使用过的材料，指导教师对此进行了审定．与我一同工 作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中敛了明确的说明，并表示了谢 意． 研究生签名：谳俊侵 时间：2D“年舌月7年日 学位论文使用授权书 本人完全了解华中农业大学关于保存、使用学位论文的规定，印学生必须 按照学校要求提交学位论文的印刷本和电子版本；学校有权保存提交论文的印 刷版和电子版，并提供目录检索和阅览服务，可以采用影印、缩印或扫摇等复 制手段保存、汇编学位论文．本人同意华中农业大学可以用不同方式在不同媒 体上发表、传播学位论文的全部或部分内容，并授权中国科学技术信息研究所 和北京万方数据股份有限公司将本人学位论文收录到《中国学位论文全文数据 库》，并进行信息服务(包括但不限于汇编、复制、发行、信患网络传播等)， 同时本人保留在其他媒体发表论文的权力． 注：保密学位论文(即涉及技术秘密，商业嵇密或申请专利等潜在需要提交保 密的论文)在解密后适甩于本授权书． 学位论文作者签名：谢俊健 导师签名：勿1叫0 签名日期：2刀“年‘月／牛日 签名日期：少口，1年6月。叩日 万方数据 基于表达谱和小RNA测序的南瓜不同盐响应机制的研究目 基于表达谱和小RNA测序的南瓜不同盐响应机制的研究 目 录 摘要 ．i Abstract．．．．．．．．．．．．． ．．．．．．．．．．．．．． ．．．．．．．．．． ．．． ．．．．．．．．．．．．．．．． ． ．．．．．．．， ． ．．．．．．．．．． ．．．．．．．．．．．．．．．．．． ．．．iii 缩略词表 ．v 第一章 前言 ．1 l课题提出 ．1 2盐胁迫对植物的伤害机制 ．1 2．1渗透胁迫 2 2．2离子毒害 2 2．3离子不平衡 2 3植物对盐胁迫的适应机制 ．3 3．1植物适应渗透胁迫的机制 3 3．2植物应对离子毒害的机制 6 3．2．1 Na+在植物体中的运输 ．．6 3．2．2植物体中主要的钠转运蛋白及其对减轻离子毒害的重要作用 8 3．2．3非损伤微测技术在研究Na+吸收转运中的应用 9 4表达谱测序和小RNA测序在植物响应非生物胁迫中的应用 ．10 4．1表达谱测序在植物响应非生物胁迫中的应用 一lO 4．2小RNA测序在植物响应非生物胁迫中的应用 1 1 5本研究的目的意义、内容 13 5．1目的与意义 ．13 5．2研究内容 ．13 第二章不同南瓜材料Na+积累模式的研究 ．．14 前言 ．．14 1材料与方法 14 1．1材料 ．14 1．2水培与NaCI处理 ．．14 1-3测定方法 ．15 1．3．1生长指标测定 。15 1．3．2离子测定 一15 万方数据 华中农业大学2016届博士研究生学位(毕业)论文1．4数据分析 华中农业大学2016届博士研究生学位(毕业)论文 1．4数据分析 ．15 2结果与分析 16 2．1各个南瓜材料生长状况 ．16 2．2各个南瓜材料Na+及K十含量及分布 17 3讨{仑 ．．19 第三章表达谱测序分析两个南瓜材料对盐胁迫的差异响应 ．．2l 前言 ．2l 1材料与方法 2l 1．1实验材料 ．21 1．2总RNA提取及文库构建 2 1 1．3转录组测序 ．22 1．3．1转录组测序数据的组装拼接 22 1．3．2转录本功能注释 22 1．4表达谱测序 ．22 1．4．1表达谱数据比对到转录组 22 1．4．2差异表达基因的筛选及显著性富集 23 1．4．3差异表达基因的qRT-PCR验证 ．23 2结果与分析 23 2．1转录组测序 ．23 2．1．1南瓜转录组测序数据统计 23 2．1．2南瓜转录本功能注释 26 2．1．3 GO功能分析 ．26 2．2表达谱测序 ．26 2．2．1南瓜表达谱测序数据统计 26 2．2．2两个南瓜材料盐胁迫下差异表达的基因 ．．27 2．2．3两个南瓜材料盐胁迫下差异表达基因的GO富集分析 33 2．2．4两个南瓜材料盐胁迫下差异表达基因的qRT-PCR验证 ．．37 3讨论 ．．38 第四章小RNA测序分析两个南瓜材料对盐胁迫的差异响应 41 前言 41 1材料与方法 4l II 万方数据 基于表达谱和小RNA测序的南瓜不同盐响应机制的研究1．1实验材料 基于表达谱和小RNA测序的南瓜不同盐响应机制的研究 1．1实验材料 ．4l 1。2总RNA提取及文库构建 ．．4l 1．3保守及特异miRNA鉴定 ．．42 1。4差异表达miR