新一代测序技术应用于microRNA检测-遗传.PDF

HEREDITAS (Beijing) 2012 6 , 34(6): 784―792 ISSN 0253-9772 技术与方法 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2012.00784 新一代测序技术应用于microRNA 检测 1 1 1 1 2 汤海明 , 陈红 , 张静 , 任景怡 , 许宁 1. , 100044; 2. , 17176 MicroRNAs(miRNAs)是一类在进化上高度保守的非编码小分子单链 RNA(~22nt), 在基因转录后调控中 发挥至关重要的作用。越来越多的证据表明, miRNAs 参与很多重要的生理和病理过程, 例如发育、器官形成、 调亡、细胞增殖、肿瘤发生等。近年来飞速发展的新一代测序技术在miRNA 检测方面具有重要的应用。文章 简要介绍了新一代测序技术3 大平台的基本步骤和原理, 测序数据的生物信息学分析方法以及新一代测序技术 在miRNA 方向的主要应用。相比于传统的miRNA 检测方法, 新一代测序技术具有通量高、对遗传物质检测完 全且准确度高, 可重复性好等优点, 在探索新miRNA 、miRNA 互补链、miRNA 编辑、miRNA 异构体检测以及 miRNA 靶基因检测等方面具有巨大优势。随着新一代测序技术的不断发展, 测序成本不断降低, 在未来几年, 新一代测序技术的使用率或将大大增加。新一代测序技术的不断应用将进一步促进人类对于miRNA 在各种生 理病理过程中的功能和调控的认识。 microRNAs(miRNAs)检测; 新一代测序技术; 新miRNA 检测; miRNA 靶基因检测 Application of next generation sequencing in microRNA detection 1 1 1 1 2 TANG Hai-Ming , CHEN Hong , ZHANG Jing , REN Jing-Yi , XU Ning 1. Department of Cardiology, Peking University People’s Hospital, Beijing 100044, China; 2. Department of Medicine, Karolinska Institute, Stockholm 17176, Sweden Abstract: MicroRNAs (miRNAs) are a class of ~22nt long non-coding RNAs. They are evolutionarily conserved and play essential roles in the regulation of post-transcriptional gene expression. The rapidly developing next generation se- quencing (NGS) has important applications in miRNA detection. This review is focused on the mechanism of three NGS platforms and their applications in miRNA detection. In contrast to traditional methods, NGS has major advantages: high throughput, pr