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东人学硕十学位论文摘要
东人学硕十学位论文
摘要
脱氧核糖核酸(DNA)是复杂的生物大分子,是生命遗传信息的载体。近年来 由于生命科学中的基因损伤与修复等原因以及分子纳米器件的应用与发展, DNA分子的电荷输运性质成为当前生命科学、物理、化学、材料科学等多个交 叉学科研究的热点。研究发现,电荷转移反应产物能导致细胞突变,光诱导电荷 转移氧化损伤DNA分子或光诱导电荷转移修复DNA分子可治疗肿瘤等,但其电 荷输运机制目前尚不清楚,甚至存在很大争议。DNA分子的电荷输运实验表明 DNA分子呈现导体、半导体、绝缘体等丰富的电学性质。所以如何从理论上解 释这一现象,弄清电荷在DNA分子中的传输机理,为利用DNA分子设计分子器 件提供理论基础,同时为DNA的突变和修复规律提供理论解释,都具有重要的 科学意义。
DNA分子中巡游电子数密度是可变的。DNA的导电通道由7/电子体系组成, 由于DNA的内部构造和分子类型以及分子所处环境的复杂性和多样性等,这些 因素都会影响着DNA分子中的巡游电子数,因此主链上的万电子数目成为一个 可变的未知数。
DNA分子是复杂的生物大分子,具有软性,其电荷输运易受来自内部和外 部的多种因素的影响,例如:分子构形、碱基序列、温度、湿度、溶液、杂质等。 由于DNA自身结构的复杂性,人们一直在寻找最为恰当的模型来对它进行研究, 到目前为止,已建立了一维紧束缚模型,鱼骨模型,梯子模型,三维紧束缚模型 等几个模型从不同的侧重点来研究DNA分子中的电荷输运现象。同时,各种因 素对DNA分子的电子结构及其电荷输运特性的影响也被广泛研究。以上理论工 作部分解释了DNA分子丰富的电学性质。DNA分子的一维紧束缚模型把DNA分 子简化为一维分子链,忽略了其双螺旋结构,而实验证实DNA分子的空间构形 对其电荷输运性质有重要影响,所以我们借鉴D.Hennig等人提出的三维紧束缚模 型,建立了描述DNA分子的三维紧束缚模型。在本文中,我们拟采用三维紧束 缚模型,系统研究了若干因素对DNA分子电荷输运性质的影响。具体内容和主 要结果如下: 1、巡游电子数密度对DNA分子电子结构和电荷输运性质的影响
东人学硕十学位论文1.1考虑到DNA是一种柔性大分子,巡游电了数变化对其电子结构有显著
东人学硕十学位论文
1.1考虑到DNA是一种柔性大分子,巡游电了数变化对其电子结构有显著 地影响,可直接导致DNA导电性质的变化,Poly(dG).Poly(dC)的晶格位形和电 子结构会随着巡游电子数变化而发生改变,能隙(最低空轨道(LUMO)与最高 电子占据轨道rHOMO)之间的能量差)随之改变,使得整个体系呈现不同的导 电性质,呈现出导体,半导体或绝缘体性质。
1.2计算了Poly(dG).Poly(dC)的基态及激发态的能带结构和晶格位形,探 讨了分子净电荷分布,研究了DNA分子的载流予性质,结果表明极化子是带电 DNA分子呈现的主要元激发,这与实验结论相一致。
2、界面耦合对金属电极/DNA分子异质结构电荷输运性质的影响
采用三维紧束缚模型和传递矩阵方法研究了界面相互作用对DNA分子电荷 输运性质的影响。结果表明,界面耦合理想时,透射率和电子定域长度都很大, 分子呈现出良好的导电性;反之,透射率和电子定域长度减小,分子导电性变差。 当分子与金属电极之间理想耦合时,从伏安特性上,我们发现,Poly(dG).Poly(dC) 的开启电压小于Poly(dA).Poly(dT)的开启电压,并且在相同的偏压下,前者的电 流值要大于后者,因此Poly(dG).Poly(dC)的导电性优于Poly(dA).Poly(dT)的导电 性。
3、结构无序对DNA分子电荷输运性质的影响
采用传递矩阵的方法研究了碱基序列无序和双螺旋结构无序对DNA分子电 荷输运的影响。由单一基对G/C构成的Poly(dG)-Poly(dC)具有较好的透射率和 伏一安特性,随着分子中A/T碱基对含量的增加,DNA分子导电性明显减弱, 这表明DNA分子的导电性强烈依赖于其碱基序列。在双螺旋结构无序中研究了
氢键键长无序和螺旋角无序对Poly(dG).Poly(dC)电荷输运的影响,结果表明:氢 键键长无序对其电荷输运有重要的影响,而螺旋角无序对其电荷输运影响不大。
关键词:DNA,巡游电子,电子结构,透射率,定域长度,电荷输 运,I.V曲线
东人学硕十学位论文Abstract
东人学硕十学位论文
Abstract
Desoxyribo-Nucleic-Acid(DNA)is a complicated biomolecular,which encodes the fundamental nature of living species.In recent years,the charge
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