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食用菌学报@2016.23(3):1~9
DOI:10.16488/j.cnki.1005~9873.2016.03.001
广叶绣球菌子实体不同发育阶段的比较蛋白质组学分析
肖冬来,马璐,应正河,江晓凌,林衍铨+
(福建省农业科学院食用菌研究所,福建福州350014)
forrelativeandabsolute
摘要:利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric
tags
结合二维液相色谱串联质谱(two.dimensional tandemmass LC.MS/
liquidchromatographyspectrometry,2D
MS)技术,研究广叶绣球菌(Sparassislatifolia)原基期、幼菇期和成熟子实体阶段的差异表达蛋白质组。采用
Q—Exactive质谱鉴定并经ProteinPilot软件搜库,对所获得的差异蛋白进行GO(geneontology)、KEGG
of and
(kyotoencyclopedia
genesgenomes)和转录因子注释分析。结果共鉴定到可信蛋白2305个,其中2219
个蛋白具有相对定量信息。与原基期相比,幼菇期显著上调蛋白104个,下调蛋白142个,子实体阶段显著上
调蛋白155个,下调蛋白460个。GO分子功能提示这些差异性蛋白主要参与催化活性、蛋白结合和水解酶活
性。KEGG代谢通路分析结果显示,差异蛋白主要涉及碳代谢、氨基酸合成、核糖体、糖酵解/糖衍生等代谢过
程。差异蛋白中与信号传导和转录因子相关的蛋白数量分别为27个和7个。
关键词:广叶绣球菌;蛋白质组;iTRAQ;二维液相色谱串联质谱
广叶绣球菌(Sparassis
用菌研究所首次在福建实现了广叶绣球菌的工厂化栽培。广叶绣球菌的研究,目前主要集中于生物学
特性、栽培、葡聚糖及其活性等方面口.6],其中的B.葡聚糖能提高人体免疫力、具有抗癌、防癌特殊
功效‘4|。
原基的形成、子实体的成熟是人工栽培食用菌过程中重要的生理过程,因此大型食用菌子实体的
发育机制是食用真菌学研究的热点内容之一[7。0。。目前,关于广叶绣球菌子实体发育的分子机制及相
forrelativeandabsolute
关基因功能的研究尚未见报道。同位素标记相对和绝对定量(isobaric
tags
liquid
tandemmass LC.MS/Ms)技术已成功应用于多种生物样品的蛋白质组学分析,是目
spectrometry,2D
前比较蛋白质组学研究常用的方法之一[11|。笔者在前期完成广叶绣球菌菌丝体转录组测序(NCBI登
录号:SRR3318775)的基础上,采用iTRAQ结合2DLC.MS/MS技术对其子实体生长发育不同阶段的
蛋白质组进行分离鉴定及生物信息学分析,为探讨广叶绣球菌子实体发生、发育及成熟的机理提供
参考。
1材料与方法
1.1供试菌株
室保藏并提供。
1.2主要仪器及试剂
Ultimate3000
RSLCnano、Q RSLCC18
液相色谱仪Dionex Exactive质谱仪、Acclaim
PepMap
收稿日期:2016—05—06原稿;2016—07—18修改稿
8)资助
作者简介:肖冬来(1981一),男,2010年毕业于福建农林大学
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