广叶绣球菌子实体不同发育阶段的比较蛋白质组学分析探究.pdfVIP

广叶绣球菌子实体不同发育阶段的比较蛋白质组学分析探究.pdf

  1. 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
  2. 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  3. 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
  4. 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
  5. 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们
  6. 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
  7. 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
食用菌学报@2016.23(3):1~9 DOI:10.16488/j.cnki.1005~9873.2016.03.001 广叶绣球菌子实体不同发育阶段的比较蛋白质组学分析 肖冬来,马璐,应正河,江晓凌,林衍铨+ (福建省农业科学院食用菌研究所,福建福州350014) forrelativeandabsolute 摘要:利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags 结合二维液相色谱串联质谱(two.dimensional tandemmass LC.MS/ liquidchromatographyspectrometry,2D MS)技术,研究广叶绣球菌(Sparassislatifolia)原基期、幼菇期和成熟子实体阶段的差异表达蛋白质组。采用 Q—Exactive质谱鉴定并经ProteinPilot软件搜库,对所获得的差异蛋白进行GO(geneontology)、KEGG of and (kyotoencyclopedia genesgenomes)和转录因子注释分析。结果共鉴定到可信蛋白2305个,其中2219 个蛋白具有相对定量信息。与原基期相比,幼菇期显著上调蛋白104个,下调蛋白142个,子实体阶段显著上 调蛋白155个,下调蛋白460个。GO分子功能提示这些差异性蛋白主要参与催化活性、蛋白结合和水解酶活 性。KEGG代谢通路分析结果显示,差异蛋白主要涉及碳代谢、氨基酸合成、核糖体、糖酵解/糖衍生等代谢过 程。差异蛋白中与信号传导和转录因子相关的蛋白数量分别为27个和7个。 关键词:广叶绣球菌;蛋白质组;iTRAQ;二维液相色谱串联质谱 广叶绣球菌(Sparassis 用菌研究所首次在福建实现了广叶绣球菌的工厂化栽培。广叶绣球菌的研究,目前主要集中于生物学 特性、栽培、葡聚糖及其活性等方面口.6],其中的B.葡聚糖能提高人体免疫力、具有抗癌、防癌特殊 功效‘4|。 原基的形成、子实体的成熟是人工栽培食用菌过程中重要的生理过程,因此大型食用菌子实体的 发育机制是食用真菌学研究的热点内容之一[7。0。。目前,关于广叶绣球菌子实体发育的分子机制及相 forrelativeandabsolute 关基因功能的研究尚未见报道。同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags liquid tandemmass LC.MS/Ms)技术已成功应用于多种生物样品的蛋白质组学分析,是目 spectrometry,2D 前比较蛋白质组学研究常用的方法之一[11|。笔者在前期完成广叶绣球菌菌丝体转录组测序(NCBI登 录号:SRR3318775)的基础上,采用iTRAQ结合2DLC.MS/MS技术对其子实体生长发育不同阶段的 蛋白质组进行分离鉴定及生物信息学分析,为探讨广叶绣球菌子实体发生、发育及成熟的机理提供 参考。 1材料与方法 1.1供试菌株 室保藏并提供。 1.2主要仪器及试剂 Ultimate3000 RSLCnano、Q RSLCC18 液相色谱仪Dionex Exactive质谱仪、Acclaim PepMap 收稿日期:2016—05—06原稿;2016—07—18修改稿 8)资助 作者简介:肖冬来(1981一),男,2010年毕业于福建农林大学

文档评论(0)

独行千里 + 关注
实名认证
文档贡献者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档