利用水稻抗旱种质研究驯化和育种对遗传多样性的影响.pdfVIP

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2019-04-12 发布于浙江
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利用水稻抗旱种质研究驯化和育种对遗传多样性的影响.pdf

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上海农业学报2016，32(4)：1-5 Acta AgricuhuraeShanghai 文章编号：1000—3924(2016)04-001-05 利用水稻抗旱种质研究驯化和育种对遗传多样性的影响卫海滨，夏辉，楼巧君，冯芳君，马孝松，梅捍卫4，罗利军+ (上海市农业生物基因中心，上海201106) 摘要：利用高通量测序获取SNP标记技术对上海市农业生物基因中心99个水稻抗旱种质进行全基因组重测 927238／2793 序，分析其遗传多样性和遗传基础。结果表明：在所有SNPs位点中，多态性比率为68．98％(1 702)，SNPs 标记密度在12条染色体上分布范围为4．5一．2个SNP／kb；供试品种间的遗传距离分布具有两个密度高峰；邻接法构建系统发育树将99个品种划分为籼稻和粳稻两个类群。综合SNPs和进化分析结果表明：水稻在自然选择和人3--珊11化过程形成复杂进化史，99个抗旱种质在DNA水平上的差异呈现两个极端，遗传距离分布范围较大 (0．003川．998)，具有较宽遗传基础和丰富的遗传多样性。本研究以期为水稻节水抗旱新品种选育的亲本选配提供理论依据。关键词：水稻；遗传多样性；抗旱性；育种；单核苷酸多态性中图分类号：S51l 文献标识码：A ofdomesticationand on diversity Impacts breedinggenetic in rice utilizingdrought—resistantgermplasms WEI Hai-bin，XIAHui，LOU Han—wei+，LUO Qiao-jun，FENGFang-jun，MAXiao—song，MEI Li—jun+ Gene 201 Center， 106，China) (ShanghaiAgrobiologicalShanghai Abstract：The ofthe99 ricevarietiescollectedthiscenter genome—widesequencing drought—resistant by wasconducted to SNPmarkersandthe was byusinghighthroughoutgenomesequenceget geneticdiversity resultsshowedthatthe of siteswas 927238／2793 68．98％(1 analyzed．The percentagepolymorphic 702)among alltheidentified the ofSNPmarkersin12chromosomeswas4．5“．2 SNPs，anddensity SNP／kb；The distributionof distancesbetweenthetestedvarietieshadtwo 99ricevarietiescould genetic