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雷公藤贝壳杉烯酸氧化酶基因的全长cDNA克隆与表达分析
[摘要]贝壳杉烯酸氧化酶(kaurenoic acid oxidase)是二菇赤霉 素生物合成途径上的关键酶,参与植物生长发育等重耍生物学过程。该文 根据雷公藤转录组数据设计特异性引物,采用PCR技术克隆得到贝壳杉烯 酸氧化酶全长cDNA序列,并进行生物信息学分析;使用实时定量PCR (qRTPCR)研究基因的诱导表达水平。克隆得到TwKAO长度为1 874 bp, 编码487个氨基酸,蛋口相对分子质量5602 kDa,理论等电点889;经茉 莉酸甲酯(MeJA)诱导后,TwKAO基因相对表达量在12h达到峰值;经植 株组织表达分析证实,TwKAO基因在雷公藤的叶中表达量最高,根中最低。 该研究首次克隆得到雷公藤KAO基因,并分析其mRNA表达特征,为深入 研究雷公藤生长发育以及祜类活性成分次生代谢研究奠定基础。
[关键词]雷公藤;贝壳杉烯酸氧化酶(KAO);克隆;生物信息学 分析;表达分析
药用植物雷公藤Tripterygium wilfordii Hook f系卫矛科木质藤本 植物,临床中多使用其根或根的木质部入药,具有抗炎、神经保护、免疫 调节、抗肿瘤等活性,可用于治疗类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等免 疫疾病。近年来发现,雷公藤中重要的二菇类成分雷公藤甲素在抗肿瘤尤 其是治疗胰腺癌[12]方面具有显著疗效。由于其广泛的药理活性,对雷公 藤有效成分药理作用、生物合成等方面的研究得到越来越多的关注[35]。
赤霉素是植物牛长发育中必不可少的激素,参与植物牛长包括种子萌 发,茎伸长以及开花等过程。而赤霉素的生物合成过程中,从ent贝壳杉 烯、ent贝壳杉醇、ent贝壳杉醛到ent贝壳杉酸,再到ent7过羟基贝壳 杉烯酸等连续反应都是由CYP450催化而成[6]。贝壳杉烯酸氧化酶 (kaurenoic acid oxidase, KAO)参与从贝壳杉烯酸到GA12的反应过程 [7],其属于细胞色素P450中CYP88A亚家族,参与赤霉素牛物合成途径 中3步连续的催化反应[8]。目前,KAO基因己从小麦[910],豌豆[11], 梨[12]等植物中克隆得到,并研究其缺失对向FI葵矮小突变体的影响 [13]。
雷公藤屮KAO基因尚未克隆得到,因此本研究以雷公藤悬浮细胞为研 究材料,克隆得到长度为1 874 bp的TwKAO基因,研究其在茉莉酸甲酯 (MeJA)诱导后240 h内基因的表达水平,并进行生物信息学分析,为进 一步研究雷公藤重要活性成分生物合成提供宝贵的基因资源。
1材料
11植物雷公藤悬浮细胞由首都医科大学中药资源与分子生药学实验 室继代保存。培养条件:05 mg?L-l 2, 4D + 01 mg?L~l KT+05 mg?L-l IBA+MS 液体培养基,25 °C, 120 r?min-l避光培养。
菌株及载体 Escherichia coli Trans 5 a 感受态细胞、pEASYT3 vector购自北京全式金生物技术有限公司。
仪器与试剂 VeritiTM96 孔梯度 PCR 仪,TF 7500 型 Real Time PCR System为美国Applied Biosystoms公司,318k型高速冷冻离心机为
SI GM A 公司;PhusionHighFidelity PCR Master Mix with HF Buffer?自 美国NEB公司;Fast Quant RT Kit (With gDNaso)>琼脂糖凝胶回收试 剂盒、RNA纯化试剂盒购自天根生化科技(北京)有限公司,EastepSuper 总RNA提取试剂盒购自普洛麦格(北京)生物技术有限公司,其他试剂为 国产分析纯。引物合成由上海生工生物工程技术服务有限公司完成,测序 服务由北京睿博兴科生物技术有限公司完成。
2方法
21RNA提取与纯化使用CTAB法提取雷公藤悬浮细胞总RNA并依据RNA 纯化试剂盒说明书进行纯化,通过1%琼脂糖凝胶电泳检测RNA质量。
22全长cDNA克隆与测序使用Fast Quant RT Kit将雷公藤悬浮细胞 总RNA反转录成cDNA,根据雷公藤悬浮细胞转录组数据设计全长特异性引 物
24TwKA0基因的诱导表达分析于雷公藤悬浮细胞继代培养12d后,使 用茉莉酸甲酯(50 nmol?L-l)诱导,设置对照组。于诱导后不同时间点 (0, 12, 24, 48, 72, 240 h)取样,每个吋间点设置4个平行样品。使 用EFLa基因作为内参基因,根据所得TwKAO序列设计实时荧光定量特异 性引物。提収雷公藤悬浮细胞总RNA并反转录成cDNA,进行TwKAO基因的 诱导表达分析。实时荧光定量反应体系:10 UL 2XSYBR green Mix, 0
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