辣椒遗传图谱的构建与辣椒素含量的QTL分析-蔬菜学专业论文.docxVIP

华中农业大学2016届硕士研究生学位(毕业)论文3．4辣椒遗传图谱的构建 华中农业大学2016届硕士研究生学位(毕业)论文 3．4辣椒遗传图谱的构建 ． 38 3．4．1分子标记的筛选 38 3．4．2分子标记的开发 38 3。4．3遗传图谱的构建 38 3．5辣椒素含量的QTL分析 43 4讨{，仑 ．．46 4．1辣椒遗传图谱的构建 ．46 4．2偏分离标记 ．47 4．3辣椒素含量 ．47 4．4辣椒素和二氢辣椒素含量的QTL分析 49 5全文总结 5 l 参考文献 52 附录多态性的SSR和Indel引物 6l 附表1：具有多态性的SSR引物 61 附表2：具有多态性的Indel引物 66 致谢 ．．68 II 万方数据 辣椒遗传图谱的构建与辣椒素含量的QTL分析摘要 辣椒遗传图谱的构建与辣椒素含量的QTL分析 摘要 辣椒是一种重要的蔬菜作物，辣椒产生的辣椒素类物质用途广泛，已经在食物 和医药卫生方面广泛应用。辣椒素含量是一个数量性状，本研究以云南特有的辣椒 种质资源12H一56和12H．55为母本和父本，应用主基因+多基因混合遗传模型对辣 椒素和二氢辣椒素含量进行遗传分析；利用SSR和Indel标记对F2群体进行分析， 构建遗传图谱，对控制辣椒素含量的基因进行QTL分析；对辣椒素合成途径中的相 关基因进行序列分析并进行基因表达分析。获得主要结果如下： 1．对辣椒素含量和二氢辣椒素含量表型性状进行主基因+多基因遗传模型分析， 结果表明，这2个性状均符合B．1模型，即2对主基因控制的加性．显性一上位性效 应，主基因遗传率分别为65．80％和75．49％。 2．对12H．56和12H．55材料中辣椒素合成途径中的相关基因，包括4CL、ACL、 ACS、BCAT、C3H,aH、FATA、HCT、PAL、PAMT,Punl基因，进行序列分析， 2个材料中只有PAL和HCT基因序列有差异，最终根据HCT基因的差异序列开发 了3对dCAPS标记DCl、DC3、DC6。对辣椒果实不同发育时期的辣椒素合成相关 基因表达量分析，结果表明2份材料中4CL、BCAT、C4H、PAMT、Punl、HCT, COMT基因表达量有差异，与辣椒素含量与基因表达量相关性分析相结合，表明HCT 基因可能导致了辣椒素含量的差异。 3．利用1227对SSR和Indel引物对亲本进行多态性筛选，检测到143对具有多 态性的引物。采用Joinmap4．0软件极大似然法和回归法构建了2个遗传图谱，采用 回归法构建的遗传图谱速度比较快，同时连锁群标记之间的距离较小而且准确。把 开发的dCAPS标记添加到图谱中构建了G3图谱，包含16个连锁群，146对多态性 引物，图谱长度为934．92 cM，平均图距7．48 cM。 4．利用QTL ICimappin94．0软件，结合辣椒G3图谱和F2群体的表型数据，检 测到1 1个控制辣椒素和二氢辣椒素性状的QTL，单个QTL贡献率5．01％～28．88％。 11个QTL分布于LGl、LGll、LGl2、LGl6连锁群上。控制辣椒素含量的qCap一 』2一J和控制二氢辣椒素含量的qDicap一12．J分布同一个区间，即标记GPMSl87和 AM396之间。 关键词：辣椒；QTL；遗传图谱；SSR；辣椒素 万方数据 华中农业大学2016届硕士研究生学位(毕业)论文Abstract 华中农业大学2016届硕士研究生学位(毕业)论文 Abstract Pepper is one of the most economically important vegetable crops．Capsaicinoids have been widely used in food and for pharmaceutical purposes and the content ofcapsaicinoids are inherited quantitatively．An F2 genetic mapping population was derived from the cross between 1 2H．56(C frutescens)and 1 2H一55(Cfrutescens)which were specific genetic resources ofYun Nan province．F2 population was used forjoint analysis ofcapsaicin and dihydrocapsaicin content using mixed major gene plus polygene inheritance model． Construction of the genetic map and QTL a