枯萎病菌诱导棉花早期根部基因表达谱的分析与GhERFB101基因的克隆.pdf

早 7号的比对组中，鉴定出 127条 pathway，注释 30122个显著差异表达基因 （含重复）。 pathway 中涉及到的显著差异表达基因可分为次生代谢产物的生物合成，遗传信息处理， 碳水化合物代谢，环境信息处理，环境适应和免疫系统等 13类。 5. 植物激素信号转导代谢 pathway 中，中棉所 12有 90类 880个已知功能的显著差 异表达基因参与；新陆早 7号有 1176个 95类显著差异表达基因涉及。其中显著差异表 达基因最多的是蛋白磷酸酶，其次为 GRAS 转录因子基因，中棉所 12中位于第三位的 7 / 是生长素响应蛋白，新陆早 号则为丝氨酸 苏氨酸蛋白激酶。 6. 植物与病原菌相互作用 pathway 中，中棉所 12的比对组中有 64类 784个显著差 异表达基因；新陆早 7号的比对组中有 68类 1076个显著差异表达基因。显著差异表达 基因最多的是 WRKY转录因子家族基因，其次为中棉所 12中的钙结合蛋白基因，新陆 早 7号中的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，第三位均为 LRR受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 7. 从表达谱中筛选探针序列，通过电子克隆结合 RT-PCR技术从中棉所 12中克隆 ERF-B1 GhERFB101(Genbank KF850521) 到一个新的 亚组转录因子基因，命名为 ： 。序 列分析表明，该基因开放阅读框 738b ，编码 245个氨基酸，含有一个保守的 AP2/ERF 结构域，在进化上与拟南芥AtERF11的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析显示， 枯萎病菌诱导后，GhERFB101基因在抗病品种根中的表达量呈现下降趋势；而在感病 品种中呈上调表达；该基因能够响应乙烯和茉莉酸的诱导，水杨酸诱导后基因表达量的 变化幅度不大。 结论：利用 Solexa高通量测序技术分析了棉花幼苗受到枯萎病菌侵染后不同时间根部组 织的基因表达谱，筛选得到大量抗枯萎病相关基因，初步揭示了棉花抗枯萎病的分子调 控机制；以表达谱为基础克隆得到的ERF-B1亚组转录因子基因 GhERFB101，是一个与 棉花抗枯萎病相关的新基因，参与了病原菌及激素的应答反应。 关键词：陆地棉；枯萎病；Solexa；基因表达谱；ERF-B1转录因子；基因克隆 II 万方数据 Abstract Objective：Fusarium wilt is a harmful worldwide disease. In recent years, people have made a lot of research works in the molecular mechanism of disease resistance, However, because we lacked of the complete understanding of transcriptome information of upland cotton, predecessors research was the analysisoftherelativelyindependentsinglegene,whichisdifficulttoobtainthesystematicunderstanding. Atthesametime,theplantresistancetopathogensistheresultofinteractionofmultiplegenes,just change asingleresistancegeneisdifficulttoobtaintheexpectedeffect.Transferingthetranscriptionfactorswhich couldregulate the expression ofmultiple genesrelated to dis