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大肠杆菌的核苷酸切除修复系统: 4种蛋白质:UvrA, UvrB, UvrC, UvrD 大肠杆菌的核苷酸切除修复系统 UvrA和UvrB复合体扫描DNA, UvrA负责检查螺旋中的扭曲,一旦 遇到扭曲, UvrA退出复合体 2. UvrB在扭曲附近将DNA局部变性, 在损伤四周产生一个单链的凸起 3. UvrB募集UvrC, 在损伤的5’和3’ 侧产生切口。 UvrC产生两个切口,一个 位于损伤5’侧8个核苷酸处,一个位于 损伤3’侧4个或5个核苷酸处。切割产生 12-13个碱基的单链DNA片段 4. DNA解旋酶UvrD将单链片段从双 螺旋上释放出来,DNA聚合酶I和DNA 连接酶对缺口进行修复和填补 高等生物中核苷酸切除修复的原理与大肠杆菌基本相同,但是对损伤的检测,切除和修复系统更加复杂,涉及25个或更多多肽 XPC负责检测螺旋中的扭曲– UvrA XPA,XPD在损伤四周形成一个凸起- UvrB 凸起在损伤部位的5’侧产生的切割位点供核酸酶ERCC1-XPF切割,在3’侧产生的切割位点供核酸酶XPG切割- UvrC 产生的单链DNA片段为24-32个核苷酸 DNA片段释放后产生的缺口被DNA聚合酶和DNA连接酶填补 转录耦联修复( Transcription-coupled repair) 核苷酸切除修复不仅能够修复整个基因组中的损伤,而且当RNA聚合酶的转录过程被某个基因中发生的转录链的损伤所终止时,它还能拯救RNA聚合酶---转录耦联修复 将核苷酸切除修复蛋白募集到受阻的RNA聚合酶上 RNA聚合酶在损伤上游正常 转录DNA 当遇到DNA中的损伤时, RNA聚合酶转录受阻,转录 停止 RNA聚合酶招募核苷酸切除 修复蛋白到损伤位置,然后从 DNA上回退或解离,以使修复 蛋白能够触及到损伤并修复 核苷酸切除 修复蛋白 转录耦联修复的意义在于将修复酶集中于正在活跃地被转录的DNA上 拯救RNA聚合酶,使转录能够继续 真核生物中转录耦联修复的核心是通用转录因子TFIIH TFIIH在转录起始中解开DNA模板的螺旋 TFIIH的亚基包括DNA解螺旋蛋白XPA和XPD TFIIH负责两个独立的功能: 在转录耦联修复中,有解旋功能的解旋酶将损伤周围的DNA解旋 在基因转录过程中帮助打开DNA模板 Transcription-coupled repair: nucleotide excision repair (NER) system is capable of rescuing RNA polymerase that has been arrested by the presence of lesions in the DNA template TFIIH TFIIH is a transcription factor including XPA and XPD (UvrB) 3. Recombination repairs DNA breaks by retrieving sequence information from undamaged DNA (重组修复通过从未受损DNA中找回序列信息来修复DNA断裂) 切除修复用未受损的DNA的一条链作为模板来替代另一条链上已受损的DNA片段 细胞如何修复DNA中两条链都断裂的双链断裂? 双链断裂修复途径( Double-strand break repair pathway):从姐妹染色体中找回序列信息 4. Translesion DNA synthesis enables replication to proceed across DNA damage (移损DNA合成使复制通过DNA损伤继续进行) DNA损伤是通过切除然后用未受损的模板重新合成来完成修复的 但是这种修复系统不能十分有效地运行,有时正在复制的DNA聚合酶仍会遇到没有被修复的损伤(如嘧啶二聚体或脱嘌呤位点),阻碍了复制的继续进行 即使细胞不能修复损伤,也有防故障机制使复制机器绕过受损的部位,这种机制称为移损合成( Translesion synthesis ) 这种机制有高度的易错性,容易引入突变,但避免了染色体不能完全复制的更坏命运 移损DNA合成: 是被一类特化的DNA 聚合酶催化的,此酶 越过损伤部位直接合成 DNA 复制时一旦在模板上 遇到未修复的损伤, DNA聚合酶III与其 滑动夹一起 从DNA上脱离下来, 并被移损DNA聚合酶 取代。 移损DNA聚合酶越过 模板链上的胸腺嘧啶 二聚体继续进行DNA 合成。 然后移损DNA聚合酶 被DNA聚合酶III替换 在大肠杆菌中移损合成是由UmuC和UmuD’蛋白的复合体承担的。 UmuC是DNA聚合酶
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