中国肿瘤临床利用基因表达谱筛选肝细胞癌中炎性微环境形成相关新.PDFVIP

1304 中国肿瘤临床 2011 年第38 卷第21 期 利用基因表达谱筛选肝细胞癌中炎性微环境形成 相关新基因的研究 ①② ③ ① ③ ② ①② 于津浦 TineCasneuf 刘芃芃 HansWinkler 任秀宝 郝希山 利用基因表达谱芯片筛选肝细胞癌（HCC）中的差异表达基因，并分析神经降压素（NTS）表达与HCC 中炎性微 摘要 目的： 环境形成的相互关系。 收集10例原发性HCC 癌与癌旁组织，提取RNA进行Affymetrix 全基因组表达谱芯片检测，同时整合GEO 方法： 数据库中同芯片平台的亚洲人原发性HCC 的mRNA 表达谱数据30 例，利用R2.9.0 软件获得差异基因列表，应用MetaCore R 2.5 ， Pathway Studio R 6.0 和Ingenuity R 1.0 软件进行信号通路分析。最后，结合HE 染色比较不同NTS 表达水平的HCC 标本中炎症反 应强度。 所有RNA 样品无降解，各芯片数据的信号强度分布均一。SMA 聚类和信号通路分析结果显示40 例HCC 标本中存 结果： 在一组独特亚群，呈现神经降压素（NTS）高表达，并伴有胞外间质重构、细胞粘附、白细胞移动、血管新生等生物学过程显著增 强。HE 染色证实NTS 高表达标本中炎细胞浸润、纤维增生和血管生成明显高于NTS 低表达的标本。 NTS 高表达可能促进 结论： HCC 中炎性环境的形成。 关键词 肝细胞癌 神经降压素 炎性微环境 肿瘤转移 基因表达谱 doi:10.3969/j.issn. 1000-8179.2011.21.002 Screening of New Candidate Genes Correlated with Inflammatory Microenvironment Genesis in Primary Hepatocellular Carcinoma Using Gene Expression Profiling 1,2 3 1 3 2 1,2 Jinpu YU , Tine Casneuf , Pengpeng LIU , Hans Winkler , Xiubao Ren , Xishan HAO Correspondence to: Xishan HAO, E-mail: hxs-yjp@ 1JnJ Joint Lab, Cancer Institute and Hospital of Tianjin Medical University, Tianjin 300060, China 2Department of Immunology, Cancer Institute and Hospital of Tianjin Medical University, Tianjin 300060, China 3Johnson Johnson Pharmaceutical Research Development, Belgium Abstract Objective: To screen differentially expressed genes in hepatocellular carcinoma (HCC) and evaluate the correlation between neurotensin (NTS) expression and inflammatory microenvironm