第6章 代谢控制分析.pptVIP

A particularly useful and important feature of MCA is that it can relate the kinetic properties of the individual reactions (local properties) with (global) properties of the whole intact pathway. This is done through the connectivity theorems that relate the control coefficients and the elasticity coefficients of steps with common intermediate metabolites Kacser, H. Burns, J.A. (1973) The control of flux. Symp. Soc. Exp. Biol. 27, 65-104. Connectivity theorem 通量－控制的连接定理Flux-control connectivity theorem P215 证明 具有低的通量控制系数的反应具有高弹性系数 反之，具有高的通量控制系数的反应具有低弹性系数 因为：具有高通量控制系数的反应的速率变化将使其它所有反应速率（具有低的通量控制系数）也发生较大的变化，而这种变化是由代谢浓度的变化传递的。所以其它反应对代谢物浓度变化一定比较敏感，即具有较高的弹性系数。 相反，具有低通量控制系数的反应的速率变化也将引起代谢物浓度变化，但代谢物浓度变化不能使其它反应发生较大的变化 浓度－控制的连接定理Concentration-control connectivity theorem 利用矩阵符号，可以将（6.34）、（6.36）、（6.38）、（6.39）、（6.40）中所有的法则概括为： I个反应，I-1个胞内代谢物 下标j、k表示代谢物，i表示反应 加和 连接 通量 浓度 I-1个等式 （I-1）2-（I-1)个等式 （I-1）I个 I个 I(I-1)个 代谢物1 代谢物2 代谢物I-1 代谢物1 代谢物2 代谢物I-1 此时I为单位阵（维数I×I）。对于非奇异阵E，控制系数为： 例6.3 由弹性系数求通量控制系数(P216) 由式6－41得： 由于知道动力学方程后求弹性系数比较容易，所以可以方便地通过弹性系数得到通量控制系数 C1J是x的减函数， P217, Figure 6. 9 6.28 例6－4 代谢控制分析举例 4个反应，3个胞内代谢物 FCCs r1 r2 r3 r4 S1 S2 S3 中间产物s3浓度的增加将阻碍第二步反应（s1转化为s2）因此增加处于反馈控制的酶E2的浓度的方法并不是提高通量的最佳方法 FCCs r1 r2 r3 r4 S1 S2 S3 从浓度控制系数可以看出：当最后一个酶的活性提高时，最后一个中间产物s3及第一个中间产物s1的浓度迅速降低然而同时第二个中间产物s2的浓度增加 在引入FCCs的概念之前，一个调节酶经常意味着一个限速步骤，但在引入FCCs的概念后发现这并不是实情。MCA理论表明限速步骤这一概念是毫无道理的，取而代之的应是FCCs值和限速程度！ 如果反馈抑制能被解除，即?32＝0，则可计算出控制系数矩阵： S1 S2 S3 r1 r2 r3 r4 此时速率控制步骤现在为酶促反应中的第二个酶。因此它为潜在的速率控制酶，即：如果抑制被去除或大量减少时，第二个反应将控制总体通量 当反馈抑制去除后，最后一行的所有三个浓度系数成为负值。增加最后一个酶的活性将降低所有中间产物的浓度。 上游代谢物（底物）为负值，下游代谢物（产物）为正值 假设构建一个新菌株，该菌株拥有一与E2相似的酶但是弹性系数不同。第二步酶促反应的弹性系数为： s3的反馈抑制减小并且 变小。具有细微差别E2的生产菌株代替了原始菌株，控制系数矩阵变为： 采用新酶后最后一个酶的通量控制能力减少，每种酶的通量控制系数都接近平均值0.25。通量控制分散，因此没有酶在酶促反应的通量控制中占优势 上面的讨论没有包括操作条件对细胞特性的影响，需要注意的是通量控制系数可能随着操作条件的变化发生巨大变化 当对具有大的通量控制系数的反应（酶）进行操作后，通量控制系数的值大小变得差不多，但是这并不一定表明经由途径的通量要比原始菌株的通量高很多