梅里埃质谱建库的规则.ppt

数据库及算法的构建思路 裴子建 2016年1月19日 梅里埃Vitek MS数据库构建的独特概念 基于种群 基于菌株 以种群代表的种属 可发现种属特异性的特点 需要许多参考菌株 以个别菌株代表的种属 快速构建数据库 不需代表典型菌株 3 质数据库构建思路 明显，稳定数据库 1046 菌种 13,790以上 分离株 (数据库里的菌株) 29,873 以上图谱 平均每个菌种有18菌株 平均每个菌种有40个图谱 1,500 菌种 9,620分离株 (数据库里的菌株) 18,808 图谱 平均每个菌种有8菌株 平均每个菌种有16个图谱 VITEK MS IVD 56 菌种 25 菌株 25 菌种 100 菌株 金黄色酿脓葡萄球菌 (S aureus) : 328株 大肠埃希氏菌 (E coli) : 475株 白念珠菌 (C albicans) : 133株 肺炎链球菌 (S pneumoniae) : 306株 5 VITEK® MS IVD 临床数据库与算法 Advanced Spectra Classifier 6 专家图谱鉴别器(ASC) 分析原理 权重矩阵分析 ASC的使用： 建立数据库 鉴定样本的图谱 特点： 没有图谱比较 软件里没有内建图谱, 只有分析蛋白矩阵重量 计算时间更快 14 7 每一个专家图谱鉴别器包含两个部分 菌种特定权重矩阵 菌种特定的分析功能:计算分析样本与权重矩阵的 相似百分比 专家图谱鉴别器(ASC) 8 菌株库建立原理质量区间分布 顶峰 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 …………………………. ..…. 1298 1299 1300 区间 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ……………… S1 S2 S3 S1 S2 S3 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ……………… + + + + + + + + + + + + + 显示 / 未显示 9 菌株库权重矩阵发展 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 …… 1300 S pneumoniae (306 isolates) + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 …… 1300 E coli (475 isolates) + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - + 1 2 3 4 ………… 306 1 2 3 4 …… 475 肺炎链球菌 大肠杆菌 10 S. pneumoniae S. pneumoniae S. aureus