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Venter :“创造了一个计算机 为父母的生命” JCVI :将 8 个由 60 个核苷酸组成的 DNA 片段, 首次人工合成实验老鼠的线粒体基因组 ? 使用 8 个只含有 60 个核苷酸的 DNA 片段, 让它们同酶和化学试剂的混合物相结合 ,在 50 ℃下孵化 1 小时, 5 天内合成出了 实验鼠的线粒体基因组,得到的基因组 能够纠正具有线粒体缺陷的细胞内的异 常。 用途:生物能源、生物除污 … ? Venter 下一步的计划就是合成某种海藻基 因组,这种新型海藻可以通过光合作用 把空气中的二氧化碳转化成汽油或者柴 油等清洁能源,从而有效解决目前的气 候变化和能源危机。 ? 疫苗、药物、生物能源、生物除污等 全 球 九 大 新 兴 科 技 展 望 ? 合成生物学 ? 通用翻译 ? 纳米导线 ? 拜埃斯氏技术 ? T 射线 ? 核糖核酸干扰分子疗法 ? 大电网的控制 ? 微射流光纤 What is Synthetic Biology? synthetic biology ? 合成生物学 (synthetic biology) 一词 最早出现于 1911 年 7 月 8 日 著名医学刊物《柳叶刀》 The Lancet. Reviews and Notices of Books. The Lancet, 1911. 178 (4584):97-99. 发表的一篇书评中。 ? 后来虽然断断续续出现过多次 , 但在 1980 年第一次以“ 基因 外科术 : 合成生物学的开始 ”为题出现在德文刊物的一篇长篇 论文。 Hobom,B. [Gene surgery:on the threshold of synthetic biology],Medizinische Klinik, 1980,75(24):834-841. ? 随着人类基因组计划的完成 , 2000 年以后 , 合成生物学一词在 学术刊物及互联网上逐渐大量出现。 合成生物学论文增长情况 合成生物学的定义 ? 加州大学伯克利分校 ( UCB) 的化学工程教授 Keasling 说 : 合成 生物学正在用“生物学”进行工程化 , 就像用“物理学”进行 “电子工程” , 用“化学”进行“化学工程”一样。 ? 哥伦比亚癌症研究中心、测序及基因组科学中心主任 Holt 说 , 合成生物学与传统的重组 DNA 技术之间的界限仍然是模糊的。 从根本上说 , 合成生物学正在利用获得的“元件”进行下一层 次的工作 ——— 对细胞进行实际的工程化。 合成生物学的定义 ? 哈佛大学医学院遗传学教授、计算遗传学中心主任 Church 说 , 主要的出发点是在把合成生物学与现有的领域 ( 例如基因工程 或细胞工程 ) 分离开来。我们已经在一次涉及一个“零件”或 少量“零件”。 合成生物学是利用我们所确信的一些“零件” 进行新生物系统的工程。它在利用从系统生物学 (systems biology) 得出的最好分析去加工制作及检验复杂的生物机器 . 合成生物学的定义 ? 明尼苏达大学物理系教授 Noireaux 说 , 合成生物学的定 义是令人困惑的 , 在很多方面就像生命的定义一样困惑。 作为一个物理学家 , 会喜欢建造机器、机器人。这正是 我们试图利用生物分子要做的事情。这看起来像工程 , 但也面临许多基础问题。 合成生物学的定义 根据上述情况 , 我们推荐“合成生物学组织” 网站上公布的合成生物学的定义 , 合成生物 学包括两条路线 : 1) 新的生物零件、组件和系统的设计与建造 ; 2) 对现有的、天然的生物系统的重新设计。 这两条路线的目的都是为了造福人类社会。 合成生物学的内容 1. 生物积块 ( BioBrick ):包括各种生物分子的合成与模块 化、亚细胞模块、生物合成的基因网络、代谢途径和信号 转导通路、转运机制等。 2. 积块接口 :如调整和修改输入 - 输出过程、调整不同亚细胞 组件间的层次化相互作用等使模块具有可拆装性。 3. 开放平台 :优化生物或非生物载体,达到提高工程系统效 率、降低其维护成本和要求、提供某种特殊的“敏感性” 及对环境的兼容性等目的。 4. 调控和通讯系统 :包括生物部件的反馈、前馈机制以及行 为和通讯方式的模块化。 5. 数学模拟 :各种功能模块的逻辑结构与仿真、预测算法和 相应软件等。 1. 生物大分子的合成与模块化 ? 蛋白质的工
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