(优质医学)用ImagePro_Plus_分析免疫组化图片.pptVIP

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  • 2020-09-06 发布于广东
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(优质医学)用ImagePro_Plus_分析免疫组化图片.ppt

3.2.2.2选择测量参数 需要测量选择区域的面积(area)与累积光密度(IOD).在测量选项中也有平均光密度这一项,但它不适用于当前的测量,不能选用. 选择面积时一般要设置一个过滤值,忽略掉面积过小的点,一般可设置为最小20象素. 还要设置一下测量的显示选项(option),一般是选择显示选择区域填充红色.还有一些其他的设置. * 选择测量参数 在分析免疫组化图象时,一般是测量选定的具有特定颜色的区域的面积与累积光密度(IOD) 对免疫组化的显微照片,一般应分析它的平均光密度.即时IOD/area.根据图象的特点,要分别测量选择区域的IOD及area.对不同的组织照片,要使用不同的测量指标来进行比较。 * 在count/size里进行这些设置 * 调出的select Measurements, * Option设置窗口 * 保存设置:file – save settings * 3.2.2.3选取特定颜色所在的区域 一般免疫组化样品中黄色的地方为阳性染色区域。在测量时应当测量这些黄色(棕黄色)区域的光密度值。不测量其他颜色部分的。因此首要的任务就是把这些黄色的区域挑选出来。 IPP是利用图片上象素点的颜色分类来选取测量区域的。其选择工具irregular AOI与segmentation是IPP最有特色,最有效的工具。 * 用IPP选取特定颜色区域的工具 选择特定颜色的区域是IPP最有特色的功能,按照特定的颜色特征选取图象中的特定区域,并计算这些区域的面积等几何尺寸与光密度数据,就是IPP分析图像工作的中心任务。 Irregular AOI:适用于选择有明显颜色边界的单个颜色区域。 Segmentation:适用于选取整张图片中具有特定颜色的所有区域。测量免疫组化图片一般使用这个工具。 * 在count/size窗口中点select color,就调出了这个segmentation工具. * 点Histogram Based,还要选HIS. * 在弹出的警告上点“是”。 * H:0-30,S:0-255,I:0-230 * 设置好的选色条件也要保存的。 * 测量光密度时,要测量灰度图片 彩色图象上象点的强度是由红蓝绿三色混合而成,如果直接在彩色图上测量光密度,会有一个系统误差。所以正规的测量需要把图象中选取的区域外部分涂白,然后转换图象为灰度图片,再测量光密度。 * 选择Transparent on White,只显示选择到的区域。再点create preview image复制出一张。 * 将复制的图片转换成灰度图片。 * 对此图片再作一次选色,这次只需选择一个强度了。I:0-230 * * 还要保存一次灰度选色设置。 * 3.2.2.4 好啦,点count进行测量。 * 看看测量统计数据。 * 可以把数据存入excel表格里。 * 3.2.2.5别急,还没完事呢。 以上测量的是选择区域内的累积光密度值IOD,但同时测量的面积却未必是正确的面积。 测量数据表里的area是图片上选择的染色区域的面积,这不一定就是我们需要的面积。 我们最终要得

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