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(三) 氨基酸?-R基团直接影响多肽链结构 半胱氨酸结构与功能特点: 氧化状态下,多肽链中不相邻的两个半胱氨酸通过二硫键相连,增强蛋白质结构的稳定性; 巯基易与重金属离子结合 。 天冬氨酸、谷氨酸结构与功能特点: 携带强负电荷,常位于水溶性蛋白的表面; 可结合带正电荷的分子或金属离子。 苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸 结构与功能特点: 侧链结构大且极性较弱或无极性,常位于水溶性蛋白的内部。 甘氨酸结构与功能特点: 是唯一不存在不对称立体结构的氨基酸,有较大的旋转自由度,赋予多肽链更多的柔性; 是最小的氨基酸,能够存在于空间致密的蛋白质中,如胶原。 组氨酸结构与功能特点: 咪唑基团容易发生质子化,进而影响其所在的蛋白质构象,因此是许多蛋白质功能的调节机制 异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸 结构与功能特点: 均含有较大的疏水侧链,其刚性结构特征及疏水相互作用都对蛋白折叠有重要的影响力,常作为水溶性蛋白的内部支撑结构 赖氨酸、精氨酸结构与功能特点: 有带正电荷的柔性侧链,常作为蛋白的亲水表面,且易于结合带有负电荷的其他分子,如DNA。 甲硫氨酸结构与功能特点: 是多肽链生物合成的起始氨基酸; 参与体内含硫化合物代谢及甲基化反应。 脯氨酸结构与功能特点: N原子在杂环中移动的自由度受到限制,常位于多肽链的转角处 丝氨酸、苏氨酸结构与功能特点: 侧链短,所含羟基常作为酶反应中的供氢体; 亲水性强,位于水溶性蛋白表面 (一) 氨基酸具有两性离子特征 氨基酸在水溶液中或在晶体状态时都以离子形式存在,在同一个氨基酸分子上带有能放出质子的—NH3+正离子和能接受质子的—COO-负离子,为两性电解质。 若一个氨基酸有3个可解离的基团,写出它们的电离式后取兼性离子两边的pK 值的平均值,即为此氨基酸的等电点。 如天冬氨酸的pI计算如下 :其中Asp±为兼性离子,因而其等电点的计算取其两侧的pK 值的平均值, 即 (pK1 + pK2) ÷ 2 = pI (2.09+3.86)÷2=2.97 即天冬氨酸的pI为2.97。 5 薄层层析是鉴定氨基酸及其修饰的经典方法 各种氨基酸在固定相和流动像中的分配系数不同,在展开过程中被分离,用茚三酮显色,观察氨基酸斑点。 四、氨基酸的理化性质: 一般物理性质 无色晶体,熔点极高(200℃以上),不同味道;水中溶解度差别较大(极性和非极性),不溶于有机溶剂。 等电点 (isoelectric point, pI) 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。 pH=pI +OH- pHpI +H+ +OH- +H+ pHpI 氨基酸的兼性离子 阳离子 阴离子 氨基酸等电点的计算 氨基酸 a 碳上的氨基及羧基各是一帶电基团,故有两个 pK,这两个 pK 平均值即为该氨基酸的 pI (等电点), 即 (pK1 + pK2) ÷ 2 = pI。 (二)氨基酸的羧基和氨基可发生多种化学反应 一个氨基酸的羧基可与另一个氨基酸的氨基反应成肽,形成共价的肽 键。通过连续的肽键,许多氨基酸即可聚合成多肽或蛋白质分子 ?-氨基参与体内多种化学反应。氨基酸的?-氨基能与醛类化合物生成弱碱,称为Schiff碱,这是体内氨基酸转氨基作用的中间代谢物 体内氨基酸化学反应 (三) 可利用氨基酸理化特性对其进行定性 定量分析 1 氨基酸与2,4-二硝基氟苯反应生成二硝基苯基氨基酸 2 氨基酸与亚硝酸反应生成氮气 3 与茚三酮的反应: 氨基酸与茚三酮共加热,生成蓝紫色化合物。在570nm(蓝紫色)定量测定氨基酸的含量。 4.紫外吸收性质: 组成天然蛋白质分子的20种氨基酸中,色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸含共轭双键对紫外光有光吸收。其吸收峰在280nm左右,以色氨酸吸收最强。 大多数蛋白质含有这几种氨基酸残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。 可利用此性质采用紫外分分光度法测定蛋白质的含量。 芳香族氨基酸的紫外吸收 (四)氨基酸定量定性分析已进入自动化时代 随着毛细管电泳(capillary electrophoresis,CE;液相层析(liquid chromatography, LC)自动化及质谱(mass spectrometry,MS)技术的发展,目前氨基酸的检测分析可以在自动分析仪器中快速完成。 核苷酸的结构与功能 第 二 节 The Structure and Function of Nucleotides 核酸是存在于细胞中的一类大分子
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