临床基因组学：染色体芯片技术在临床遗传病诊断的应用.ppt

病例8 男 21个月 1）精神运动发育迟缓 2）钟形胸 3）肌张力低下 4）先天性尿道下裂（重型） 5）腹胀，脐疝，腹股沟疝 6）羊水过多3000ml，羊水I度粪染， 38+6周剖宫产 7）3.15Kg ， Apgar评分1分钟，5分钟，10分钟均9分 芯片结果：14号染色体单亲二倍体(UPD) 父源性UPD14：Kagami syndrome。包括产前羊水过多，产后患儿面容异常，智力低下，全面性发育迟缓，胸廓异常，先天性腹疝。 母源性UPD14：产前、产后生长发育落后，肌张力低, 中度面容畸形，小手，青春期性早熟，肥胖，学习障碍。患者临床表现谱广泛，轻度表型可接近正常，重度表型与Prader-Willi syndrome相似。 病例9 男 9个月 发育迟缓 消瘦 营养不良 喂养困难 多条染色体发生AOH 其父母是二级亲缘关系（18.4%） Association of CNV with obesity Association of CNV with obesity Association of CNV with epilepsy CMA产后出生缺陷检测适应症 智力低下 生长、运动、语言发育迟缓 多发畸形 自闭症谱系疾病 拓展适应症 癫痫 神经,精神系统疾病：ADHD, 精神分裂症 肥胖 矮小 先天性心脏病 过度生长综合征 出生缺陷患儿检测流程 * Genotype first vs Phenotype first Whole genome screening vs Candidate approach Graf WD, Le Pichon JB, Bittel DC, Abdelmoity AT, and Yu S. Practice parameter: evaluation of the child with microcephaly (an evidence-based review): report of the quality standards subcommittee of the American Academy of Neurology and the Practice Committee of the Child Neurology Society. Neurology. 2010;74(13):1080-1. Ledbetter DH. Cytogenetic technology--genotype and phenotype. N Engl J Med. 2008;359(16):1728-30. Bejjani BA and Shaffer LG. Clinical utility of contemporary molecular cytogenetics. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:71-86. 由于CMA不能检测染色体平衡易位，故染色体核型分析和FISH技术在某些特定情况下具有优势。 染色体末端发生缺失或重复 染色体末端同时发生缺失和重复 单亲二倍体：染色体D,G组 非整倍体情况：染色体D,G组 染色体内部发生缺失和（或）重复 International Standard Cytogenomic Array Consortium(ISCA): / Database of Genomic Variants(DGV): http://projects.tcag.ca/variation/ Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans using Ensembl Resources (DECIPHER) : http://decipher.sanger.ac.uk/ National Center for Biotechnology Information(NCBI): / UCSC Genome Bioinformatics Site：/ Genetics home reference: / GeneTests: /sites/GeneTests/ 相关数据库 染色体芯片选择 商业化的全基因组芯片：Affymetrix Cytoscan 靶向微阵列芯片： 波士顿儿童医院ClariView Array(4×180k） 贝勒医学院aCGH+SNP芯片(4×180k、2×400k） ISCA研发的ISCA aCGH+SNP芯片(4×180k） 香港中文大学研发的胎儿芯片aCGH(4×44k） Thank You ! DNA与组蛋白包装成核小体-螺线管-超螺线管-染色单体。经过四级折叠，DNA压缩了8