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生物信息学基础大作业报告 报告主题 系统发育树的构建方法和研究进展 班级 计科 0901 姓名 王海颖 总学号 0304090111 目 录 - 2 - 一 引言 ............................................................................................................................................ 3 二 系统发育树的构建方法 ............................................................................................................ 3 2.1 概括介 ....................................................................................................................... 3 2.2 具体介 ....................................................................................................................... 4 2.2.1 基于距离的方法 ????????????????????? 4 2.2.2 最大 法 ....................................................................................................... 4 2.2.3 最大似然法 ....................................................................................................... 5 2.2.4 叶斯 估 方法 .......................................................................................... 7 三 系 育 的改 算法 ................................................................................................... 7 3.1 算法和模 退火算法 ...................................................................................... 7 3.2 古 DNA序列构建生物系 育 .......................................................................... 7 3.2 基于 28S rDNA序列构建 耳属系 育 .................................................... 7 3.3 基于全蛋白 的微生物构建系 育 ....................................................... 8 3.4 一种基于 粒体完全基因 的 密度分布的脊椎 物系 育 构建 方法 ........................................................................................................................................ 8 四 评价方法的改进 ........................................................................................................................ 8 4.1 算法和模 退火算法的改 .......................................................................... 8 4.2 用 EM算法 行参数估 .........................................................................................