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中国鱥属鱼类形态学比较和温度适应的研究 目录 摘要 i Abstract v 缩略语表 ix 第一章 文献综述 1 1 鱥属鱼类概况 1 1.1 鱥属鱼类简介1 1.2 我国鱥属鱼类的分类和资源分布2 1.3 鱥属鱼类的研究进展5 2 鱼类形态学研究概述 7 2.1 鱼类形态学研究方法7 2.2 形态学特征在鱼类生物学研究中的应用7 3 鱼类遗传进化和环境适应性的研究 8 3.1 鱥属鱼类线粒体基因组研究概况8 3.2 鱼类系统进化的研究9 3.3 鱼类群体遗传学的研究10 3.4 鱼类环境适应的研究11 4 鱼类环境适应研究中转录组学的应用 12 4.1 转录组及其测序技术12 4.2 转录组学在鱼类环境适应研究中的应用13 5 本研究的目的和意义 14 第二章 我国鱥属鱼类的形态学比较研究 15 1 前言 15 2 材料与方法 16 2.1 鱥属鱼类样本采集16 I 华中农业大学2019 届博士研究生学位论文 2.2 形态学指标测量及预处理 17 2.3 数据分析 18 3 结果19 3.1 鱥属8 种鱼类形态学指标间的差异 19 3.2 形态学指标的主成分提取21 3.3 基于形态学指标的判别分类22 3.4 鱥属8 种鱼类的形态学聚类25 4 讨论27 4.1 鱥属鱼类的形态学差异及其主导因子27 4.2 鱥属鱼类的形态学判别分类和亲缘关系聚类29 第三章 阿勒泰鱥、拉氏鱥和尖头鱥年龄与生长的比较研究32 1 前言32 2 材料与方法34 2.1 样本采集 34 2.2 耳石处理 34 2.3 体长分布和年龄结构 35 2.4 体长和体重关系拟合 35 2.5 生长方程 36 2.6 生长特性分析 36 3 结果37 3.1 样本体长分布 37 3.2 年龄结构 38 3.3 体长和体重关系 38 3.4 体长和体重的生长方程 39 3.5 生长特性40 II 中国鱥属鱼类形态学比较和温度适应的研究 4 讨论 43 4.1 鱥属鱼类的体长分布和年龄结构43 4.2 鱥属鱼类的生长特性44 第四章 鱥属鱼类系统进化关系的研究 47 1 前言 47 2 材料与方法 48 2.1 已有线粒体基因组数据的获取48 2.2 短尾鱥和吐鲁番鱥样本DNA 提取49 2.3 短尾鱥和吐鲁番鱥部分线粒体基因片段的扩增49 2.4 线粒体基因序列比对和拼接51 2.5 鱥属8 种鱼类样本RNA 的提取51 2.6 RNA 样品的测序、组装和注释52 2.7 鱥属内直系同源基因的鉴定53 2.8 系统发育树的构建54 3 结果 54 3.1 转录组组装与注释54 3.2 鱥属8 种鱼类的直系同源基因55 3.3 线粒体基因片段及直系同源基因的碱基替换饱和性55 3.4 鱥属鱼类的系统发育关系56 3.5 鱥属鱼类的进化速率57 4 讨论 58 4.1 鱥属鱼类的系统进化关系58 4.2 鱥属鱼类进化速率的差异59 第五章 阿勒泰鱥群体遗传多样性与环境因子关系的研究 61 1 前言 61