‘秦冠’苹果遗传连锁图谱的构建及褐斑病抗性基因的定位.pdfVIP

摘要 摘要 我国是世界上最大的苹果生产国和消费国，在世界苹果产业中占有举足轻重的地 MarssoninaLeafBlotch 位。苹果褐斑病 （ ）是我国苹果生产中的主要病害之一。目前， 生产上对苹果褐斑病的防治以化学防治为主。然而，随着抗药性菌株的出现以及环境 保护和食品安全问题的日益加重，药剂防治的难度和使用风险也与日俱增。为此挖掘 苹果褐斑病抗性品种中的抗病基因，选育抗病品种，是控制苹果褐斑病最经济有效的 手段。本研究以苹果褐斑病高抗品种‘秦冠’和易感品种‘长富2 号’及其杂交后代为试材， 构建‘秦冠’苹果的高密度SNP 遗传连锁图谱，进行褐斑病抗性相关基因座的定位和候 选基因的筛选，旨在利用现代分子生物学和生物信息学技术，为挖掘 秦冠苹果褐斑病‘ ’ 抗性相关的关键基因奠定基础。 获得的主要结果如下： 1. 依据2018年田间定植的苹果杂交群体植株的抗病分级结果，选择极端抗病和极 端感病的F 代各17株。通过对216对SSR 标记进行多态性和重复性检测，筛选出58 1 对在 秦冠 中表现为杂合且均匀分布在苹果基因组上的多态性‘ ’ SSR 标记。利用基因组 扫描方法 （GSA）对亲本和极端表型后代进行检测，通过卡方检验分析‘秦冠’等位基因 分离比，获得了2 个可能与抗性基因关联的标记，分别为LG6 的C4065 和LG12 的 CH01g12 CH01g12 Hi02b07 Hi02f12 。对 周围标记进行进一步检测发现 和 同样可能与 抗性基因关联。最终预测褐斑病抗性基因座可能位于‘秦冠’LG6 的C4065 附近和LG12 的29.5~43.0 cM 区间内。此外，还检测到2 个可能与致死因子连锁的标记，分别为 CH03c02 NZ02b1 和 。 2.以‘秦冠’× ‘长富2 号’的122 株杂交后代为作图群体，采用20K SNP Illumina ® Infinium array 124 DNA ‘ ’ ‘ 2 ’ 对 份 样本进行基因分型，构建了秦冠和长富 号 的高密度 ‘ ’ 17 1,112.3cM 1,100 SNP 遗传连锁图谱。秦冠 图谱包含 条连锁群，总长为 ，包含 个 标记，相邻标记平均间距为1.59cM （858.18Kb），覆盖了全基因组物理图长的91.33%； ‘ 2 ’ 17 1,114.2 cM 1,082 SNP 长富 号 图谱同样包含 条连锁群，总长为 ，包含 个 标记， 1.66cM 848.33Kb 86.79% 相邻标记平均间距为 （ ），覆盖了全基因组物理图长的 。 3. 在2018、2019两年，对田间定植的苹果杂交群体植株的发病率、落叶率等褐斑 病抗性相关的表型指标进行调查，并评价其抗病等级；在2019年，对杂交群体植株离 体叶片进行褐斑病孢子悬浮液的人工喷雾接种和定量悬滴接种，统计发病程度和病斑 面积。基于构建的遗传图谱进行QTL 定位。通过KW 检验定位到‘秦冠’LG15和LG17 I 西北农林科技大学硕士学位论文 上的