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生物化学是运用化学的理论和方法研究生物体的化学组成、化学变化及其与生理功能之间的联系的一门学科。 其目的在于研究生命现象的化学本质，从分子水平上阐释生命的秘密。;教 学 目 标;第一章 蛋白质(Protein)的结构和功能 蛋白质的分子组成 蛋白质的分子结构 蛋白质结构和功能的关系 蛋白质的理化性质及其分离纯化; Protein(Pr)的分子组成 组成Pr分子的元素： C、H、O、N、S； P、Fe、Cu、Zn、Mn、Mo、Co和I. 各种Pr的含氮量很接近，平均为16%. ; 氨基酸(amino acid, AA) 组成Pr的基本单位—氨基酸: 组成Pr的编码AA仅有20种，均为L-α-AA （甘、脯氨酸除外）. H 氨基酸侧链 R Cα COO NH3+ ;蛋白质标注重点一定要记,其他也要看; 20种基本氨基酸的分类 （一）据R基和理化性质分为四类：;一、 酸性氨基酸（共2种）;二、 碱性氨基酸（共3种）;三、 非极性的疏水AA（选Gly Pro);四、 极性中性AA（选Met Cys);（二）按结构分为三类： 芳香族AA： 苯丙、酪、色氨酸（R基都含有苯环） 杂环族AA： 组、脯氨酸（均含有一无规律环） 脂肪族AA： 其余15种AA;20种编码AA需掌握的基本知识： AA名称； AA的三字母和单字母英文符号； 记忆要决： 三字母符号基本上就是该AA英文名称的前三个字母[ 9 种AA例外：两种酸性AA（天冬氨酸D、谷氨酸E）和他们 的酰胺（天冬酰胺N和谷胺酰胺Q）、 两种碱性AA（赖氨酸K和精氨酸R） 及三种芳香族AA（苯丙氨酸F、酪氨酸Y和色氨酸W ）] 3 AA的结构式尽量了解.;AA的理化性质;2. 紫外吸收性质 Trp,Tyr的最大吸收峰在280nm附近. ;3. 茚三酮反应 AA与茚三酮试剂加热反应，生成蓝紫色化合物，最大 吸收峰在570 nm附近. 茚三酮作显色剂可进行AA的定性、定量测定.;肽;肽：AA通过肽键连接形成的化合物叫肽； 2个AA形成的肽叫二肽； 3个AA形成的肽叫三肽. 多肽：许多AA以肽键连接形成的链状化合物叫多肽链. 多肽链中AA已不是完整的分子，称之为AA残基.; 肽的命名：某氨基酰某氨基酰…..某氨基酸. 肽的简写：Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu ;生物活性肽;2. 多肽类激素和神经肽 催产素、加压素： 9肽 促甲状腺素释放激素：3肽 N-Glu 焦谷氨酸 C-Pro 脯氨酰胺 神经肽：在神经传导过程中起信号转导作用的肽类。;蛋白质的分类; 蛋白质的分子结构;蛋白质的分子结构(重点); 蛋白质的二级结构 肽链某一区段中AA残基相对的空间位置。 指此肽 段主链骨架原子的相对空间位置.不包括侧链构象. 维系的键：H 键 包括α-螺旋 β-折叠 β-转角 无规卷曲 ? ;; α-螺旋 α-helix （P14图2-10） (重点) （1） 多个肽键平面通过AA的α-碳原子旋转，以每3.6个AA 残基为一周，螺距为0.54 nm. 蛋白质中的α-螺旋基本上都是 右手螺旋，右手螺旋比左手螺旋稳定，左手螺旋仅在个别蛋 白质中含有。 （2） 每个肽键的N-H氢和第四个肽键的C=O氧形成氢键， 氢键方向与螺旋长轴基本平行；肽链中全部肽键都可形成氢 键，以稳固α-螺旋结构. （3） AA侧链分布在螺旋外侧，也影响螺旋的形成和稳定. ; 侧链R基对α-螺旋形成的影响 R基电荷性质：