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QM/MM法 Combined ab initio Molecular Mechanics 0.0 * 181h， 近年来人们开展了一种量子力学与分子力学结合的方法〔QM/MM方法〕，该方法既包括了量子力学的准确性，又利用了分子力学的高效性。 根本思想是：用量子力学处理感兴趣的中心，如酶和底物结合的活性位点，其余局部用经典分子力学来处理。 0.0 * 181h， 分子力学简介 分子力学法(MM)用于预测大分子的几何构型，其势函数可用于分子动力学模拟(MD) 一、原理 忽略分子振、转、平动运动。原子视为经典粒子，原子间作用力用经历势函数表示 体系的平衡几何构造由能量最低原理确定 0.0 * 181h， 二、作用在粒子上的瞬时合力 原子 i 在其它原子的作用势场 Ei (ri) 中运动 在平衡位置 总作用力： 0.0 * 181h， 三、有效作用势近似 粒子的势能 Ei 及梯度 ?Ei 借助经历势函数计算 经历作用势 ? 二体及三体以上作用势的叠加 0.0 * 181h， 分子力学中的分子能量 1 键的伸缩 2 键角弯曲 3 键的扭转 4 范德华力 5 静电作用 6 氢键作用 0.0 * 181h， 键伸缩(Bond Stretching) 键伸缩势能函数的Taylor展开 Morse势能函数 展开后得 存在关系式 MM3力场 0.0 * 181h， 键角弯曲(Valence Angle Bending) 类似于键伸缩的势能函数 MM3力场取到6次项，Amber力场只取到4次项 存在的问题： 1 在键角接近180o的时候函数不能正确反映实际的能量 2 无机化合物中，同一类键角在同一化合物中存在不同 平衡构型 0.0 * 181h， 键扭转(Torsions) 周期性势能函数 j：扭转角的多重度；y：相角 0.0 * 181h， 面外弯曲(Improper Torisons) 三种定义方式： 0.0 * 181h， 范德华力(van der Waals Interations) 1 色散作用: 瞬时偶极作用 考虑到更高的电极矩 2 交换排斥作用 近核处 远离核处 Drude模型 0.0 * 181h， 分子或原子之间的静电相互作用 原子点电荷模型 三种方式确定原子上的电荷 按原子类型确定原子上的电荷 根据原子之间的连接方式与电负性确定原子上的电荷 使用量子化学方法计算得到原子上的电荷 0.0 * 181h， 氢键 (Hydrogen Bond) 0.0 * 181h， 偶合项 (Cross Terms) 比较重要的偶合项 0.0 * 181h， Weitao Yang〔杨伟涛〕 Duke University, Durham Jiali Gao〔高嘉立〕 State University of New York at Burffalo QM/MM解决了大分子参与的化学反响的计算， 使计算酶催化、蛋白质等参与的生物化学反响成为可能 开展QM/MM法的两位出色华人青年化学家 0.0 * 181h，