分子标记辅助选择归纳.pdfVIP

第六章 分子标记辅助选择 选择是育种中最重要的环节之一。所谓选择，是指在一个群 体中选择符合要求的基因型。但在传统育种中，选择的依据通常 是表现型而非基因型， 这是因为人们无法直接知道个体的基因型， 只能从表现型加以推断。也就是说，传统育种是通过表现型间接 对基因型进行选择的。这种选择方法对质量性状而言一般是有效 的，但对数量性状来说，则效率不高，因为数量性状的表现型与 基因型之间缺乏明确的对应关系。即使是质量性状，有的也可能 会因为表型测量难度较大或误差较大而造成表型选择的困难。另 外，在个体发育过程中，每一性状都有其特定的表现时期。许多 重要的性状（如产量和品质）都必须到发育后期或成熟时才得以 表现， 因而选择也只能等到那时才能进行。 这对于那些植株高大、 占地多、生长季长的作物，特别是果树之类的园艺作物，显然是 非常不利的。总之，传统的基于表型的选择方法存在许多缺点， 效率较低。要提高选择的效率，最理想的方法应是能够直接对基 因型进行选择。 分子标记为实现对基因型的直接选择提供了可能，因为分子 标记的基因型是可以识别的。如果目标基因与某个分子标记紧密 连锁，那么通过对分子标记基因型的检测，就能获知目标基因的 基因型。因此，我们能够借助分子标记对目标性状的基因型进行 选择，这称为标记辅助选择（ MAS ）。这是分子标记在育种中应 用的最主要方面。 第一节 质量性状的标记辅助选择 如前所述，传统的表型选择方法对质量性状一般是有效的， 86 因为质量性状的表现型与基因型之间通常存在清晰可辨的对应关 系。因此，在多数情况下，对质量性状的选择无须借助于分子标 记。但对于以下三种情况，采用标记辅助选择可提高选择效率： （1）当表现型的测量在技术上难度很大或费用太高时； （2 ）当表 现型只能在个体发育后期才能测量，但为了加快育种进程或减少 后期工作量，希望在个体发育早期（甚至是对种子）就进行选择 时； （3）除目标基因外，还需要对基因组的其它部分（即遗传背 景）进行选择时。另外，有些质量性状不仅受主基因控制，而且 还受到一些微效基因的修饰作用，易受环境的影响，表现出类似 数量性状的连续变异。许多常见的植物抗病性都表现为这种遗传 模式。这类性状的遗传表现介于典型的质量性状和典型的数量性 状之间， 所以有时又称之为质量 - 数量性状。 不过， 育种上感兴趣 的主要还是其中的主基因，因此习惯上仍把它们作为质量性状来 对待。这类性状的表型往往不能很好地反映其基因型，所以按传 统育种方法，依据表型对其主基因进行选择，有时相当困难，效 率很低。因此，标记辅助选择对这类性状就特别有用。一个典型 的例子是大豆孢囊线虫病抗性的标记辅助育种（ Young 1999 ）。 本节首先介绍质量性状标记辅助选择的基本方法（前景选择 和背景选择） ，然后介绍它们在育种上的应用 （基因聚合和基因转 移）。 一、前景选择 对 目 标 基 因 的 选 择 称为 前 景 选 择 （foreground selection; Hospital and Charcosset 1997），这是标记辅助选择的主要方面。 前 景选择的可靠性主要取决于标记与目标基因间连锁的紧密程度。 若只用一个标记对目标基因进行选择，则标记与目标基因间的连 锁必须非常紧密，才能够达到较高的正确率。假设某标记座位 （M/ m）与目标基因座位（ Q/q ）连锁，重组率为 r ，F 代基因型 1 为 MQ / mq